一般情况下，小儿灌肠治疗，在医疗上是不被重视的。灌肠对儿童造成的伤害有：
1.灌肠的配比较低，目前FDA认可的可以灌肠的药很少见，大多数都不能使用。
2.灌肠会损害孩子的肛门和直肠，而药物则会对直肠、肛门造成一定的伤害。
3.灌肠灌胃时，主要通过静脉途径吸收，多数经过肝内消化，造成肝损伤。
建议尽量不要让儿童灌肠，以免影响身体健康。
损坏肠道。因为孩子的肠道结构还有发育完全，属于比较脆弱的，灌肠后容易出现急性肠胃炎，损坏肠胃的正常消化功能。引发肠粘膜水肿。因为灌肠的剧烈性，导致孩子的肠胃内膜撕裂是经常有的事情，还会伴随腹痛不止的情况。
宝宝肠套叠需要在医生指导下进行灌肠。
宝宝患有肠套叠，给宝宝进行灌肠处理是不会有太大的危险的，家长不用过于担心。而且给宝宝灌肠主要是给宝宝的肛门打气到一定的压力之后，会将套叠部位的冲开，缓解病情。在做了灌肠方法之后，一定要注意护理，而且要注意清淡饮食。尽量采取少食多餐的原则，多喝水有利于避免肠套叠的再次发生。
一般情况下，灌肠若按照正确的操作方法则无危害。具体分析如下：
通常来讲，灌肠是将药物灌入直肠内达到其治疗的目的，一般分为清洁灌肠和保留灌肠两种。其中，清洁灌肠适应于结直肠手术的术前准备、内镜检查前的肠道准备，还可以用于粪便嵌塞的治疗等。而保留灌肠一般对药物的量、温度有严格的要求，如温度在36度左右，药物常用量在50至100ml，此方法是治疗直肠肛门疾病和妇科炎症的常用方法。
灌肠是将一定量的液体流入肛门，经直肠灌入结肠，以帮助患者清理肠道、排便、排气或者由肠道供给药物或营养，达到确定治疗或者治疗目的的方法。将灌肠的管子插在肛门上十厘米左右即可，不可太过于深，也不要出现溢出的表现。
通常情况下，小儿叠肠灌肠后出现腹泻是很常见的现象。灌肠可以减轻肠胃的压力，帮助消化道排泄。另外还需要进行静脉营养和抗生素的注射。随时注意病情的变化，如不能改善，必须尽快进行手术，避免延误。由于儿童的各项器官还不十分成熟，免疫力也比较低，建议平时要做好相关护理，避免受到疾病的侵袭，一旦出现不适要及时就医治疗。
