要进行全身抗炎治疗，建议口服头孢类抗生素，加甲硝唑类药物，可以控制炎症，局部消毒以后把脓肿切开引流。引出脓肿内的脓汁，这样可以明显缓解疼痛，还使得炎症得到进一步的控制。
主要是由于智齿冠周炎而导致的，由于颌骨的退化和牙齿退化不成比例，往往导致第三磨牙萌出位置不足而出现阻生，阻生的牙齿刺激周围的牙周组织产生炎症，称为智齿冠周炎。口服奥硝唑头孢和洛索洛芬钠改善缓解症状。
牙龈脓肿是牙龈组织的局限性化脓性炎症，一般它是牙周炎的一个并发症。治疗时首先要积极治疗原发病，对牙周炎进行系统治疗，同时对牙龈脓肿进行局部的切开、排脓、引流，还要加强口腔卫生，用口腔含漱液，饮食要避免刺激性饮食，戒烟戒酒减少局部刺激。如果是牙齿的原因造成的对牙齿要进行治疗，多发性的牙龈脓肿也可能出现全身反应，如发热等，要配合全身治疗。
小孩肛周脓肿建议及时就诊，通过抗感染进行治疗。
小孩的肛周脓肿如果发病时间比较短，还没有形成明确的脓腔，这种情况下一定要积极的就诊，通过抗感染治疗，因为小孩一般不使用药物治疗，所以建议静脉输注抗生素，或肛周脓肿表面涂抹抗生素。如果小孩的肛周脓肿已经明确形成脓腔，建议积极的手术治疗。一般可以做肛周脓肿切开引流术。
肛周脓肿的明确诊断还是要依靠肛肠病专科医生的对患儿肛门局部的检查，必要时行局部或腔内B超检查以明确病变的范围。如果局部肛周脓肿的没消退反而增大，或局部变软，说明局部已成脓，可以选择切开排脓，引流通畅即可。
