唇腭裂是母亲在生长发育过程中一些不利因素造成的。这些因素可归纳为遗传因素和环境因素两大类，临床实践中经常发现唇腭裂患儿，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育。
发育畸形做了引产，现再次怀孕，患者因有胎儿畸形发育史，本该要做常规的孕前检查，查找引起胎儿先天发育不良原因，但患者还没来得及做。不能确定是否再次发育畸形可能。引产后两个月又检查出怀孕，子宫内膜还未修复好，土地太贫瘠，有可能导致胎儿发育不良，流产可能。患者引产后未积极避孕，产后没多久就怀孕。
遗传因素，唇腭裂的患者往往在其直系或旁系亲属中也可发现类似的畸形。营养因素，各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生。感染损伤，内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形。孕妇频繁接触x线或微波等，都有可能引起胎儿发育异常而导致唇腭裂的发生。有研究表明，吸烟饮酒也会造成胎儿唇腭裂的发生。
腭裂手术的最佳时间是在8个月左右手术。没有严格意义上的标准，它取决于多方面的因素，体质比较正常而裂隙并不大的孩子，建议8个月左右手术；对于发育比较好的孩子，而且裂隙又特别微小，可以提前到6个月进行手术；而对于裂隙很大体质又比较差的孩子，会延期几个月，但是要求孩子在1岁以前完成腭裂手术的修复。
腭裂是最常见的先天性畸形，也是先天性畸形的治疗效果比较好的。如果发现早期手术修复和治疗能像正常人一样大大改善容貌，语言和发音功能明显改善，并能像正常人一样学习、生活和工作。治疗的比较好的时间是在学会说话之前。
