小儿在腹泻时多少都伴有肠道菌群的紊乱，可服用一些肠道微生态制剂，或肠黏膜保护剂。肠道微生态制剂和肠黏膜保护剂可以帮助缩短腹泻病程，效果良好。婴儿腹泻治疗方法具体还要看孩子的病情。病症重则需要去医院就医。
引起腹泻的原因有很多种，不同的情况治疗的方法是不一样的。如果是肠道功能紊乱引起的，有可能是喂养方式不当，纠正喂养方式就可以。如果是肠道功能紊乱引起的就需要服药治疗。
婴儿腹泻推拿的方法是按揉宝宝的足三里，以膝盖髌骨下方的凸起处为起点，向下四指宽胫骨外侧，用大拇指的指肚按揉这一点100-200下。也可以把手掌摊开，放在宝宝的腹部，逆时针轻揉50下左右，但一定要逆时针揉腹，顺时针揉腹则是调理便秘的。还可以让宝宝平躺在床上，用一手的食指、中指、无名指并拢，用三指指腹在宝宝腹部绕圈按摩。以腕关节连同前臂作顺时针或逆时针方向环形移动摩擦，每次3-5分钟。
宝宝腹泻，应该保暖，不要吃冷的东西，不要吃太油腻的食物，不要吃生冷的水果。可以给宝宝一些益生菌。如果腹泻严重，可以吃一些药物调节脾胃，帮助消化和治疗腹泻。腹泻一般是由于饮食不当造成消化道的疾病，因此适当的腹泻其实是把不易消化的食物排出体外的过程，对婴儿的身体也是有好处的，没有必要直接止泻。只要避免腹泻次数过多，造成脱水的现象即可。
婴儿出现腹泻应注意清淡饮食。
小儿轻度腹泻，可继续母乳喂养6个月以下的人工喂养、6个月以上可以用米汤或水稀释牛奶或其他代乳品喂养2天，以后恢复正常饮食的患儿年龄在6个月以上，可以选择粥、面条或烂饭、蔬菜、鱼、肉末等，禁忌食物如粗粮、生冷瓜果、冷拌莱等通常需要注意少吃，避免加重胃肠负担，容易引起病情加重，不利于婴儿的身体健康歌。