感染的来源可因心，肺，以及其他脏器感染波及脑室和蛛网膜下腔系统，或由颅骨，椎骨，脑实质感染直接蔓延引起，部分病例可以通过颅骨，鼻窦或乳突骨折或神经外科手术进入蛛网膜下腔引起感染，由腰椎穿刺引起的少见。致病菌经血循环侵入蛛网膜下腔后，由于缺乏有效的免疫防御，细菌大量繁殖，菌壁抗原成分及某些介导炎性反应的细胞因子刺激血管内皮细胞，促使中性粒细胞进入中枢神经系统，诱发一系列软脑膜的炎性病理改变。
脑膜炎球菌特点形态呈肾形成双排列，凹面相对。脑膜炎球菌抵抗力弱，对寒冷、日光、热力、干燥、紫外线及一般消毒剂均敏感。脑膜炎球菌经飞沫传染，也可通过接触病人呼吸道分泌物污染的物品而感染。潜伏期约1~4天。本病的发生和机体免疫力有密切的关系，当机体抵抗力低下时易感。
肺炎双球菌是一种细菌，又叫肺炎链球菌，会形成呼吸系统疾病，比如急性气管炎和肺部感染，肺炎双球菌不是病毒，肺炎双球菌使社区获得性肺炎常见的致病菌之一，严重的时候可以形成大叶性肺炎，患者会表现出高热和寒战的症状，也会出现铁锈色的痰液，在胸部CT和胸片上会出现大叶石变性改变。肺炎双球菌一般会聚集在人的鼻腔咽喉部，具有一定的致病力，
脑膜炎是一种有生命危险的疾病，应立即治疗。症状出现就应马上去急诊。常规治疗如果患上脑膜炎，患者应到医院就医直至感染完全被根除，大约需2周时间。如果患者感染上细菌性脑膜炎，将会使用大剂量抗菌药物，可能用静脉注射。抗生素被广泛采用治疗细菌性脑膜炎。因为抗生素对病毒性脑膜炎不起作用，应该加用抗病毒的药物。还经常采用输液和休息疗法。
脑膜炎双球菌，是流行性脑脊髓膜炎的病原菌，革兰染色阴性，需氧，有13个血清型，对理化因素抵抗差，对干燥，热，消毒剂敏感。主要引起流行性脑脊髓膜炎，5岁以下儿童多见，表现为发热，恶心和出血性皮疹等，严重者有剧烈头痛呕吐和颈强直，暴发性病情凶险，1-2天内出现暴发性紫癜，休克，DIC以及严重的中枢神经系统症状。对青霉素，磺胺药敏感，且其容易通过血脑屏障。针对脑膜炎双球菌的疫苗可以有效防止流脑。
脑膜炎双球菌疫苗就是流脑疫苗，并不是乙脑疫苗，不能混为一谈，其实乙脑也就是们所俗称的流行性乙型脑炎。注射流脑疫苗是为了预防流行性脑脊髓膜炎。所以脑膜炎双球菌是流脑。
