两种。根据瘘管位置的高低可分为高位肛瘘和低位肛瘘，高位肛瘘的瘘管位于外括约肌深部以上，低位肛瘘的瘘管位于外括约肌深部以下。一旦确诊肛瘘，须尽快手术治疗。
肛瘘不按期分。肛瘘分为低位肛瘘和高位肛瘘。瘘管管道位于肛门外括约肌深层以下的肛瘘就是属于低位肛瘘。瘘管管道位于肛门外括约肌深层以上的肛瘘就是高位肛瘘。
病因主要有以下方面：血行感染糖尿病、白血病、再生障碍性贫血等病，因机体抵抗力降低，常由血行感染引起肛瘘；直肠肛门损伤。外伤、吞咽硬物，肛门镜检查等损伤肛管直肠，细菌侵入伤口引起；由于痔疮而引起的瘘道；肛裂反复感染；便后没有清洁及饮食习惯。
可以服用抗生素抗感染治疗，然后局部涂抹乳膏，每次排便后用温水清洗肛门，保持肛周的局部清洁，但是如果肛瘘反复发作，瘘口比较多，形成了复杂性肛瘘，使用保守的治疗方法效果不好，要选择手术治疗，主要是手术切开引流。
肛瘘可以通过手术治疗。治疗的方法有肛瘘切开和切除术、切断肛管直肠环和括约肌、姑息切除术等，这些传统手术方法弊端较多，如切断肛管直肠环和括约肌手术过程会损伤括约肌导致大便失禁，而姑息疗法虽然不切断外括约肌但切不完全。手术的关键是尽量减少肛门括约肌的损伤，防止肛门失禁．同时避免瘘的复发。
