当胎儿宫内窘迫时，会引起肠缺血和痉挛，肛门括约肌因松弛而排出胎粪污染羊水。当胎儿缺氧时，首先是呼吸暂停，然后含胎粪的羊水被吸入呼吸道中，引起呼吸道感染等一系列症状，出现后以呼吸急迫为主，同时伴有其他脏器的损伤。
新生儿在分娩时，如果将胎粪吸入到气管内是很危险的，容易引起窒息。所以当发现新生儿吸入了胎粪，可以运用气管切开术将胎粪取出。如果是将胎粪吸入到胃内，容易引起胃部不适，出现呕吐恶心的症状，从而影响胃的正常消化功能，也是很严重的。
新生儿吸入胎粪，无论顺产或剖宫产，必须将呼吸道内羊水及胎粪吸干净，若仍提示血氧饱和度较低，或存在其他合并症时，应转入儿科进行治疗，必要时需借助呼吸机吸氧，提高血氧饱和度，并配合抗炎治疗。胎粪吸入可能导致严重并发症，即肺动脉高压，死亡率达30%左右。但即使发生胎粪吸入，医生与医护人员也会竭尽全力进行抢救，减少并发症的发生。
胎粪吸入综合征，是指胎粪通过支气管到达了肺部，胎粪进入肺部，会影响正常的气体交换，出现呼吸困难、呻吟、呼吸急促的现象，严重的会出现青紫现象，会影响到生命健康，有些人会发生缺氧，最终导致脑部的一些损害。
一般情况下，新生儿吸入胎粪比较严重，具体分析如下：
新生儿在生产过程中，若将胎粪吸入呼吸道，会造成胎儿呼吸困难。因此如果新生儿吸入胎粪，通常比较严重，可以通过气管切开来清除。吸入胎粪会导致肠胃不舒服，会有反胃的情况，影响到胃的正常消化能力。家长要给新生儿多饮水，还要注意保持新生儿的呼吸道畅通，有利于控制病情，促进身体恢复正常。
宝宝胎粪污染，如果是轻度的，宝宝精神好吃奶好，没有出现惊厥抽搐等症状，一般控制感染一个疗程就可以了，如果宝宝出现了惊厥抽搐，或者是感染控制不明显，同时出现了败血症，就要采取营养神经等综合治疗。