如果肾囊肿直径少于4厘米，无肾盂肾盏明显受压，无感染、恶变、高血压，或症状不明显者，只需密切随访观察，定期B超复查。如果肾囊肿过大可以使用穿刺放液等的方法治疗，囊肿去顶术和肾切除。可以治愈。
囊性肾癌是肾细胞癌的一种特殊病理变化，约占肾脏恶性肿瘤的1%到2%左右，一般继发于囊肿，尤其是复杂性囊肿，由于其病理特点，囊性肾癌的预后较好。没有发生肿瘤的转移，五年生存率可以达到90%以上，囊性肾癌已经出现全身脏器的转移，则及时手术后预后也不佳，手术的死亡率约在2%到10%左右，术后五年生存率，则需要根据病理的发展来确定。
孕妇出现肾囊肿是不太严重的一种病症。但是建议密切观察。
肾囊肿，顾名思义，就是肾实质的一种囊性病变，通常为良性病变，若肾囊肿的体积很小，只要经常复查。若患者出现血尿、蛋白尿等肾功能损害时，就应该到医院就诊。孕妇若出现肾囊肿，无明显症状，可暂时不需要办理，甚至更大，亦可于投产后处理。建议定期进行产前检查，明确胎儿和孕妇的身体状态。
胎儿肾囊肿无需进行治疗。
因为胎儿肾囊肿的发病原因，与遗传因素或者先天发育异常有关。绝大多数的囊肿都属于良性病变，生长速度非常缓慢。单发的肾囊肿，对于胎儿的身体健康以及出生后的身体健康，都没有明显的不良影响，通常是不需要进行特殊治疗的。如果囊肿体积增大，可以进行手术治疗或穿刺抽液治疗。但如果对胎儿的身体较大时，应选择终止妊娠。
肾囊肿如果比较大，还是有一定危险性的，囊肿囊壁较薄，较大的囊肿随时都可能在外力撞击时，造成囊肿破裂等，引起出血，因此有一定的危险性，而且囊肿较大时，会影响正常肾功能，引起肾衰竭。
儿童肾囊肿早期通常没有症状。
儿童患肾囊肿要引起重视，及时治疗，囊肿逐渐增大会有腹部肿块、腰痛、血尿、蛋白尿等症状。家长要重视，要带儿童及时到医院检查治疗。一般要检查血常规、尿常规、B超及肾功能，一般通过手术的方式治疗。生活中不要吃巧克力和辛辣的食物，多休息，保证规律的作息，注意做好保暖，避免感冒。
