厌氧菌感染人体后可引起多个部位感染，如呼吸道、肠道、泌尿系统、腹腔感染、胆道感染等，且多继发于基础病或免疫力低下者。本身无特异症状，症状主要为累及器官的症状，发生于中枢神经系统的感染可出现发热、头痛、颅内高压等，发生于呼吸系统的可出现咳嗽、胸闷、咳痰等，发生于肠道的可出现腹泻、腹痛等。
妇科阴道厌氧菌感染的症状，有一部分人是没有任何症状，有症状的女性主要表现为阴道分泌物增多，有腥臭味，有时会有外阴瘙痒或烧灼感。分泌物是灰白色，稀薄而不粘稠。确诊后要按疗程，规范治疗，细菌性阴道病容易复发，应及时看医生，对症治疗。
一般对于厌氧菌感染的患者，如果是体表部位的厌氧菌感染，需要开放创口，如将创口切开引流，并且将脓液引出。另外，局部注意用双氧水擦拭消毒之后，再用生理盐水或者蒸馏水冲洗，再用碘伏消毒覆盖无菌辅料或者创可贴。
口腔厌氧菌感染，大多发生在牙龈炎或牙周病的病人身上，再就是牙结石的病人中也有可能存在，导致牙龈的肿痛。口腔的异味，要积极治疗，可以看一下口腔科，可以用抗厌氧菌的药物口服，控制感染，有牙结石可以需要先洗牙。
牙齿厌氧菌感染，发生在牙龈炎或牙周炎，再就是得牙结石的也有可能存在，导致牙龈的肿痛，口腔的异味，需要积极治疗，可以看一下口腔科，可以用抗厌氧菌的药物口服，控制感染，有牙结石可以需要先洗牙。
