耳廓畸形的病因尚不十分明确，未能发现特殊的确定致病因素，从环境和遗传方面的研究都表明有多种因素可能会导致畸形的发生。
除了遗传因素外，环境因素，包括生物、理化和心理因素也可能会导致耳廓畸形：
1、孕初期感染致病性病毒：包括感冒病毒、水痘带状疱疹病毒等。
2、母亲患免疫性疾病和糖尿病。
3、辐射及环境污染。
4、化学因素：怀孕早期使用激素类、磺胺类、部分中草药、抗病毒类药物、庆大霉素、链霉素、四环素、白霉素等抗生素。
5、孕期经常接触烟酒也是易感因素。
6、怀孕初期受到精神刺激也是诱发因素之一。
耳廓畸形需要手术治疗，为了不影响孩子的身心健康，手术应尽量争取在学龄前完成，婴儿耳廓畸形的种类有杯形耳、耳轮畸形、矫正治疗、治疗时间是两周左右，宝宝耳廓畸形好的治疗时间是出生后7-30天。
一般情况下，新生儿耳廓畸形可能是由于某些原因，阻碍胎儿的生长，从而造成身体的缺陷。具体分析如下：
第1鳃弓的生长率为15%，第二鳃弓为85%，胎儿1、2鳃弓的发育异常可导致外耳畸形，例如：小耳、招风耳、杯状、副耳等。当只有局部的软骨索条或突出的时候，往往伴随着外耳道的关闭和耳腔的异常，则必须进行外科治疗。耳朵外形不对劲，其它情况都是可以做的。
先天性颈椎畸形有一定的危险。
1.先天性颈椎畸形会造成颈部脊髓神经受压，造成肢体无力、疼痛、麻痹等症状，患者会出现肢体瘫痪，对患者的生活造成一定的负面影响。
2.先天性颈椎畸形还会引起椎动脉的走行方向的变化，会影响到大脑的血液供应，引起大脑的收缩，出现头晕恶心、胸闷心慌、走路不稳等症状。
3.先天性颈椎畸形在创伤后极易出现骨折和脱位，造成颈椎脊髓的损害，严重者甚至有可能威胁到患者的性命。
先天性脊柱畸形可以通过坐姿、佩戴矫形支具、外科矫形改善，建议患者积极治疗，具体分析如下：
先天性脊柱畸形有两种类型，一种是姿势性的，另一种是结构性的。坐姿、佩戴矫形支具、定期复查可以改善姿势性先天性脊柱畸形，如果在这个过程中畸形加重或矫形不满意，可以进行外科矫形。结构性先天性脊柱畸形指的是先天性椎体发育不良，比如楔形椎、半椎体，或者是未知的脊柱畸形，不能用支架来矫正，需通过手术治疗。
先天性并指多指畸形需要把手指分开，剩下的指骨就会被切掉。
这种疾病通常是由软组织连接而成，只在基部的基底，与其他关节相邻，而不是共同的。这样的话，切除起来就容易多了。有些手指多并指，是指骨有翘融合，这个是一种比较复杂的现象，通常可以将多余的指骨去掉，然后将另一根手指的指骨分开，这样会对正常的关节造成一定的损伤。
一般情况下，并指多指畸形不需要植皮，但如果是并指畸形，则需要进行植皮。