切除治疗术，早期肾穿刺造瘘鵻，充分引流，观察肾功能恢复情况若肾功能恢复鵻，则矫治梗若，功能鵻不能恢复，且对侧肾功能良好者，应行患侧肾切除术；保守治疗，选择敏感有效的抗生素，有助于将脓肿控制，消灭在早期阶段。
脑脓肿治疗的时间，一般都很长，起码讲抗炎可能要4~6周，经过4~6周的抗炎，才能开展下一步治疗。
还需要根据患者影像学结果来观察其脓肿，是已接近切除，还是已被彻底包埋，之后患者症状是否得到了彻底缓解，进而确定是否需要持续抗炎治疗。
总之其抗感染时间，相对于其他的肺炎、腹腔等感染，治疗时间，大概相对长一点。
肺脓肿得治疗15天到20天。具体时间也需要结合病情的轻重程度以及个人的体质决定。出现肺脓肿之后，在早期要在医生指导下及时选择抗感染的方式进行改善，通常病程的时间很短，大概20天左右能够治愈。如果患者没有及时治疗，可能导致病情越来越严重，因此需要选择抗生素类的药物进行改善，整个病情可能会超过20天。也可能会成为慢性肺囊肿。
可在切开脓肿后，用探针仔细检查内口，然后切开瘘管，适当切除皮肤和皮下组织，内口周围组织也稍加切除，使引流通畅。如内口较深，瘘管通过肛管括约肌，可采用挂线疗法。以上手术优点是不再形成肛瘘。
盆腔脓肿治疗好可以采用手术治疗。腹腔镜手术可以很好的控制盆腔脓肿或输卵管卵巢脓肿的病情发展。可以口服抗生素药物进行治疗，还可以配合中草药口服并外治，症状严重还可以采用微创手术，将脓肿切开引流。
