进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
肛肠科检查方式有很多种，可有肛门视诊，即用拇指轻轻分开病人的臀部，观察肛门及肛周有没有脱出物、外痔、外口、脓肿，也可以看到肛门周围有没有色素沉着，有没有裂口，如果有裂口，应该观察一下裂口的位置、裂口的种类及个数。
梅毒检查通常有两种方式，第一种方式是取局部的分泌物，或者是病变组织查梅毒螺旋体。比如一期梅毒的硬下疳、二期梅毒的扁平湿疣、三期梅毒的树胶肿，我们从这些皮损处取出组织或者分泌物，在暗视野显微镜下，或者是通过镀银染色来查梅毒螺旋体。第二种方式是血清学检查，即抽取静脉血，采集血清，然后进行梅毒抗体的检测。通常我们检测的是梅毒特异性抗体和非特异性抗体，也就是我们通常所说的TPPA或TPHA和RPR检测。
肛肠检查有常见的有肛门视诊是肛肠检查的第一步。直肠指诊，可以触摸观察是否有直肠息肉、直肠腺瘤甚至一些位置比较低的直肠恶性肿瘤。还有置入肛门镜检查，肛门镜检查可以明确地观察直肠粘膜是否有感染，是否局部存在裂口。
可以做彩超检查，配合做尿常规检查，如果出现了急性膀胱炎，可能会出现尿急尿频。并且需要防止膀胱炎，导致出现上行性感染，反复发热比较容易出现肾炎的情况。平时多注意休息。
