一般不能根除。经过治疗一般是不会复发的，烙法，是应用针和烙器，在火上烧灼后，进行手术操作的一种方法。烙法适用于高位带蒂息肉和无恶变的广基息肉，也可用于止血。
目前治疗肛瘘性的疾病主要是采取手术的方法进行治疗，但是根据临床方面的统计，病人在接受了肛瘘手术后是很容易复发的，一般凡是经过肛瘘手术治疗的病人96%以上都会出现复发的现象。也就是说肛瘘手术后复发率高达96%甚至以上。
肛瘘多久能痊愈；手术后按时换药，平时注意卫生，勤清洗，便后清洗，一般需要2-4周可以痊愈。建立正常的膳食习惯，因肛瘘的发生与湿热有关，对于油腻饮食，可以内生湿热，所以不宜多吃。养成良好的排便习惯，每日排便后坐浴保持肛门清洁，对预防感染有积极作用。避免一直保持同样姿势，坐着工作的人每隔一小时要能走动三、四分钟。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
肛瘘不能自己康复，肛瘘是肛周脓肿破溃以后形成的疾病，主要构成是内口，外口和瘘管，其中瘘管是一个坚硬的结缔组织管道，是不会自己康复的。只能通过手术将瘘管切除，内口敞开才能康复。
