一般情况下，儿童手足口病可以通过临床诊断和实验室等方式来确诊。如果患儿临床上有病情发展迅速、发热、皮疹等症状，就可以进行临床诊断。如果患儿的症状不典型，实验室需要进行病原体的检测，通过检测黏膜或者是粪便组织，如果检测出手足口病的病毒就可以明确诊断了。确诊后家长需要在医生的指导下给患儿服药进行治疗，避免自行用药。
是否出现了瘙痒不舒服，有可能是护理不当或者伴随有皮肤的过敏导致，不属于手足口病，可以到医院的皮肤科给孩子检查来看一下，平时注意饭前便后洗手，因为刚到幼儿园也有可能会有一定的不太适应。
手足口确诊方法主要根据临床症状和体征，主要是起病急，突然发热，出现流口水、拒绝进食，在口腔、手、腿等部位出现斑疹或丘疹，后转为疱疹，周围有红润，疱里略有浑浊的液体。一般常规检查血常规主要是白细胞略低或正常。尿常规、便常规无异常。也可病毒检测，但一般时间在2-4周出结果。因手足口病易传染，出疹子部位较为特别，故较易诊断。
手足口症确诊方法是让孩子张开嘴，检查孩子的口腔是否有米粒大小的泡泡，以及泡泡的四周有无红色的圈，如果有的话，那就证明孩子口腔长了皮疹，疑似手足口病。可以检查孩子的双手，看看有无相同的米粒大小的泡泡，亦或是一些小红点。
首先是需要临床诊断，医生会根据他的症状，流行病学史来做出一个临床诊断，如果有接触史，在出现这些典型的症状，发热，手、口、足、臀部，出现了这些手足口的疱疹，那么就做出一个临床诊断。如果核酸找到了手足口常见的一些病毒，当然不一定是EV71，也不一定是柯萨奇病毒，只要找到了其中一种就可以确诊。
