2周岁的婴儿发烧39度，可以口服布洛芬或对乙酰氨基酚退热，如果体温继续上升，可以通过肌肉注射赖氨匹林针或退烧药物灌肠，通过血液常规来判断是否是病毒感染，如果是细菌感染，可以口服抗病毒药物，如果是细菌感染，可以口服抗生素和抗感染的药物。
如果血液检查没有发现异常，可以根据自己的经验选择抗生素和抗病毒药物，一天后进行血常规检查，确定是否需要进一步的治疗。
婴幼儿睡觉的时候出现了发热的症状，考虑这种症状是和睡觉没有什么关系的，首先可以做个血常规检查来了解有没有出现病毒感染。同时还要观察咽喉部有没有出现红肿充血的表现。
发烧在儿科常见的原因有感染性和非感染性因素，感染因素有细菌感染、病毒感染、支原体感染、EB病毒感染。发烧就要及时就医。非感染性因素有结缔组织病，如幼年类风湿、红斑狼疮，血液系统疾病如白血病也会以发热为主。感染发热临床较多的有上呼吸道感染、消化系统感染、诺如病毒感染等。
从西医来讲可能与宝宝神经发育不完善有关。宝宝在白天醒着时神经抑制比较明显，下丘脑体温调节中枢体温调节尚且可以发挥作用。睡觉时神经抑制解除就容易发烧。从中医角度来讲，宝宝睡觉时阳气入里，阳气郁于体内，散热少则引起发热。
发烧好不好，这个问题要辩证来看。发烧是人体对感染的一种全身性防御反应，轻度或中度的发烧有利于增强机体防御系统的活性，提高人体的抗病能力，发烧时白细胞释放增多、吞噬细胞作用增强，有利于感染的控制。
