一般情况下，小孩吃肠虫清有副作用。
孩吃肠虫清大多没有什么严重的不良反应，少数病例有轻度的头痛、头晕、恶心、呕吐、腹泻、口干、乏力等不良反应，是不需要处理的，它是可以自行的消失的，一般不需要特殊治疗，家长平时需要注意宝宝的饮食，均衡营养，同时还需适当带宝宝出门活动，能够促进宝宝身体的新陈代谢，让宝宝更快的生长发育。
儿童服用肠虫清，也就是常说的阿苯达唑，需要年龄满两周岁，服用两片，一次顿服就可以，儿童的服用剂量和成年人是一样的，服用药物以后，可以杀灭肠道内的多数寄生虫，寄生虫死亡以后，虫体可以发生分解，所以从排出的大便中并不能找到寄生虫。
两岁以上的儿童晚上服用2片。两岁以上的儿童单纯蛲虫、单纯轻度蛔虫感染，晚上服用1片，顿服。小于两岁的小儿禁用，严重肝肾、心功能不全和活动性溃疡病患者禁用；服用后可有的部分孩子可能会出现恶心、呕吐、腹泻、口干乏力、发热、皮疹、头痛，停药以后可自行消失。治疗蛔虫病史，偶见口吐蛔虫的现象。服用肠虫清时晚上不要吃油腻的食物。
备孕期的女性或者已经怀孕的孕妈妈补充叶酸，但是补充叶酸要科学，不要盲目的去补充。按照WHO指南的指导，无不良妊娠史的女性每天补充400mg的叶酸，如果有不良妊娠史则每日补充800mg的叶酸。叶酸补充过量也会引起一些不良，如干扰微量元素锌的代谢、造成维生素缺乏的症状。在医生的指导下适量的进行补充。
长期服用会导致过敏、血管神经性水肿、肾功能障碍、肾衰和少尿、心血管系统心肌梗塞或脑血管意外、可能继发于高危病人的血压过低胸痛、心悸、心律失常、心绞痛、雷诺现象。
这种药物需要一次性顿服。因为这种驱虫药物吃过之后，只有小部分能在体内达到一个杀灭寄生虫的效果，大部分以原形的形式排出体外，一次性顿服基本上都能够达到杀灭寄生虫的效果，不需要重复服用。
