新生儿乙肝疫苗接种后会出现瘙痒、红肿或伴有轻度疼痛、小硬结，这是局部皮肤反应，全身反应，可以出现发热，多数为低热，也有少数出现高热，通常一天内消退。还有的出现疲劳感。
新生儿出生24小时内接种乙肝疫苗，常规的乙肝疫苗注射是016方案。
新生儿在出生24小时之内，要及时的接种第1针乙肝疫苗。如果出生24小时之后这种乙肝疫苗会影响到疫苗的预防效果。一个月和六个月的时候分别再注射后面的两针。若母亲是乙肝感染者，出生婴幼儿是低产儿、低体重儿在出生后更要加强一针，需分别在0、1、2、6个月注射乙肝疫苗。
一般新生儿在出生24小时以内就需要接种第一针乙肝疫苗和卡介苗。在出生满一个月时接种第2针乙肝疫苗。第二个月接种脊灰疫苗。第三个月接种脊灰疫苗和百白破疫苗。
在新生儿出生以后，一般需要进行卡介苗的接种，以及乙肝疫苗第一针的接种，一般情况下，在孩子出生24小时之内，需要接种这两种疫苗，但是如果孩子有明显的早产，或者出生有明显的畸形，或者生病的话，可以考虑推迟接种疫苗。但是，对于正常足月出生的孩子而言，都需要及时的接种卡介苗以及乙肝疫苗的第一针，以后在不同的月龄阶段都有相应的疫苗进行接种，所以，接种疫苗可能会比较频繁一些，具体接种疫苗的类型，可以根据孩子的疫苗接种本来进行相应时间的接种。
为了有效的预防乙肝病毒的传染，乙肝疫苗的免疫接种纳入基础的接种范围以内，孩子出生以后，按照0-1-6月份的时间进行正规的疫苗接种。新生儿的母亲是乙肝病毒感染者，尤其是大三阳的患者，孩子出生以后，除了正规进行疫苗的接种，还需要使用乙肝高效价免疫球蛋白，一般在出生后24小时内尽早使用，然后在半个月以及一个月的时候，分别再次使用，可以有效的预防乙肝病毒的垂直传染的发生。
新生婴儿在出生之后，就要立即的接种乙肝疫苗，同时也要注射乙肝免疫球蛋白，接种第二针，六个月左右，需要接种第三针。在接种疫苗的期间，不要出现感冒、发烧的症状，很容易影响接种的药效。
