肛瘘一旦确诊要手术，吃药和打针都没有治疗意义。手术之后伤口完全长好，需要一个半月左右的时间。术后需要每天换药，换到伤口完全长好，要多休息避免运动，饮食清淡。
肛瘘可以少量吃鲤鱼的，肛瘘一般都是肛周脓肿继发而来，表现为肛门周围瘘口，瘘口流出淡黄色液体或者粪便。高位肛瘘首选挂线疗法，低位肛瘘手术切除。术后注意肛门处卫生，禁止抓挠，防止感染，勤排便，防止便秘。
电疗仪治疗，运用现代肛瘘电疗仪的高温物理技术治疗，利用电弧放电产生高温，对局部组织进行烧灼，以切开肛瘘达到治疗目的。冷冻治疗，适用于低位单纯性肛瘘的治疗，是利用液氮使瘘道发生凝固性坏死。继而脱落，形成新的创面而自愈。
流脓：脓液多少与瘘管大小、长短及数目有关。新形成或炎症急性发作期的瘘管脓多、味臭、色黄而浓厚，经久不愈的瘘管脓液较少或时有时无。脓液急剧增多，局部脓肿，体温增高。常因肛瘘炎症急性发作或有支管形成。结核性肛瘘脓液多而清稀，呈米泔水样，可有干酪样坏死物。肿块：肛缘索条状硬块。
肛瘘能吃粉干的，有肛瘘的情况下，建议不要吃辛辣的食物，也不要饮酒即可，其他的食物对病情影响不大，但是确诊后可以遵医嘱积极安排手术，否则对正常的生活影响大，观察是否有疼痛。