深蹲膝关节疼要尽量多休息，避免负重的劳损以及剧烈运动等。膝关节是一个复杂的关节，包括股骨下端、胫骨上端、半月板、前后交叉韧带等。由于长时间的深蹲，半月板后角会受到股骨髁和胫骨平台的挤压，导致关节逐渐退化，甚至断裂，导致膝关节疼痛。如果出现膝关节疼痛，需要通过MRI来确定半月板是否受到了伤害，半月板有明显的损伤，或者是严重的，可以用关节镜切除半月板，减轻痛苦。在此过程中要注意调整你的工作方式，减少下蹲动作，保护你的半月板。
深蹲如果出现腰疼很可能患有腰肌劳损。腰肌劳损主要是由于长时间劳累，导致腰部的肌肉出现慢性损伤，产生疼痛症状。深蹲的时候会拉伸腰部的肌肉，如果本身腰部的肌肉已经存在损伤、劳损就会诱发出现疼痛症状。对于患有腰肌劳损的病人急性期卧床休息，病情缓解，可多参加体育锻炼，增强腰部肌肉力量，防止病情复发。
深蹲的时候，腰会有酸痛感，这是因为在下蹲的时候，腰部受到了很大的压力。
在下蹲的过程中，最重要的承载位置是四头肌和腰间的肌肉。在一般的条件下，腰的肌肉起到了稳固身体和稳固脊椎的作用，使其能够平稳地进行下蹲。如果是因为负重太多，或是因为腰部的位置不对，可能会造成腰部的负荷过度，造成腰部的肌肉韧带受损，进而引起腰痛。
深蹲腰疼是和深蹲的方法不对或者姿势不当有关的，如果以前就有腰疼，不要进行深蹲锻炼，有可能因为锻炼不当导致腰疼症状加剧。如果锻炼的时候出现腰疼，也是要立即终止锻炼，按摩疼痛部位，可以适当用小燕飞的动作缓解。
该有可能是膝关节的韧带，或者半月板拉伤，三墩的时候，牵拉引起的疼痛，主要考虑是剧烈运动或者外伤引起。到医院做一个膝关节磁共振检查明确诊断，先不要活动太多。根据检查结果进行相关治疗。
