亚临床甲减患者通常无特殊表现，因此造成亚临床甲减病人诊断病情，常因查体时被查出。
亚临床甲减常发生于女性，男性相对较少。亚临床甲减者，若症状较明显，会有和甲减一样的症状，如感觉无力、困倦、反应迟缓等，会出现便秘，皮肤干燥，粗糙，毛发干枯，脱落。有些病人可有三分之一眉毛以外的部分脱落，许多病例合并高胡萝卜素血症，病人表现为手和脚呈姜黄色。此外还容易出现恶心呕吐等情况，还有一些人会出现贫血。测试病人肝功，还可发生肝功能异常，血脂可有高脂血症。
甲减常见的症状有，怕冷，乏力，腹胀，皮肤粗糙，手掌姜黄色等，如果甲减进一步加重，还会出现心包积液，多浆膜腔积液，血脂异常，甚至合并冠心病等，成人后发病重者表现为粘液性水肿，故又称为粘液性水肿，昏迷者称为粘液水肿性昏迷，胚胎期或婴儿期发病者，严重影响大脑和身体生长发育，成为痴呆侏儒。
甲减的病人眼睛有毛病，认为存在甲状腺相关性眼病的潜在危险。
甲状腺相关性眼病包括结节性红斑等眼部炎症反应，也可以导致眼内异物等并发症。如甲状腺相关性眼病，为眼眶内慢性疾病，病因多认为是甲亢，甲减和某些桥本甲状腺炎病人。这种情况下也容易出现眼外肌麻痹和视神经萎缩等并发症。眼睛发生病变后，可呈现上睑挛缩的症状，眼球单侧或双侧复视，运动障碍。在这一阶段当中最常见的症状就是流泪，眼痛以及畏光等情况。
再有一种可能是角膜发生溃疡，结膜充血和水肿。在这些症状当中最常见的就是眼睑下垂和眼肌痉挛等问题。许多病人一旦受到视神经的影响，会影响视力，使发生视力减退。
儿童期甲状腺功能减低：表情呆板，鼻扁宽，鼻梁下陷，两眼距离远，眼泡肿胀，嘴唇厚并向前突出，舌头增大，声音嘶哑，牙齿不长或稀少，个子不长或长得很慢，智力发育极差，只能照顾自己吃饭、大小便。这就属于甲状腺功能减低的症状症状。
甲减症状一般不会自行消失。
患者可能会出现怕冷、反应迟钝、心动过缓、便秘、腹胀等症状，严重时会影响月经正常，甚至导致不孕不育。甲减需要用甲状腺激素替代治疗。可以先从小剂量开始，定期检测甲状腺功能，在医生的指导下逐渐增加，直到甲状腺功能恢复正常。部分患者经过一段时间的治疗，可能会逐渐减量甚至停药，达到临床治愈。大多数甲减患者最终可能需要终身应用甲状腺激素治疗。
