宝宝有肠炎可能是消化不良，可以口服助消化药缓解症状。如果说有炎症，就是要考虑使用抗生素的治疗，如果是功能性的，可以考虑使用药物，合并胃蛋白酶等，也是可以帮助改善的了。同时要注意少食多餐，细嚼慢咽，忌暴饮暴食，以小米粥为主食，尽量不要吃肉制品。肉制品不好消化。
直肠炎的治疗有灌肠，对于粪便硬块嵌顿导致的直肠炎应采取灌肠，解除粪便压迫。由于引发直肠炎的病因较复杂，治疗原则应根据引发直肠炎的病因及疾病采取相应的治疗措施。可以通过粪便、涂片或活检组织进行细菌、真菌和病毒检测；相关抗体及毒素测定。要注意休息和饮食。
新生儿肠炎会出现恶心呕吐，食欲减退，腹胀，腹泻，腹痛等一系列的症状，可以在医生指导下予抗生素以及抗病毒的药物治疗，同时需要给予营养支持，并且要维持水电解质平衡，避免出现水电解质平衡紊乱以及休克的症状。
新生儿肠炎是由多种病原体引起的，如细菌、病毒、真菌等。其中常见的有细菌和病毒。所以需要确定什么是病原体感染。
在治疗中，如果腹泻呕吐严重，可以短时间禁食8小时，然后开始喂养。母乳或稀释牛奶或腹泻奶粉为佳。补充液体，防止脱水，纠正脱水，这要看宝宝腹泻的程度。
抗生素用于感染，微生态调节剂益生菌用于补充肠道正常菌群。所以肠炎的治疗要看宝宝的情况。
一般情况下，新生儿肠炎是由于小儿的肠道粘膜屏障功能差，在进食时，不洁食物进入就会感染肠道的炎症。
一般母乳喂养的孩子，增强肠道免疫力的抗体，在母亲乳汁含有，所以患肠炎的概率比较小一些。但如果卫生没有注意，或者奶瓶没有清洁、消毒，冲调奶粉时间过长，也是有可患肠炎的可能性。建议去医院进行大便常规检查，已确定是否是肠炎，当患了肠炎，建议使用敏感的抗生素治疗，在恢复身体健康后，及时补充肠道微生态制剂。
