一般来说，孕妇在孕期出现了支原体和衣原体的症状，一定要及时处理，否则会造成胎儿的生长异常，严重的还会造成死亡。现在可以在医生的指导下选用的药物是阿奇霉素片，不会对生殖产生什么作用，只要坚持服用2-3个星期，定期进行复查，基本上就可以将其彻底消灭。4-6个星期后，支原体衣原体还是不能变成阴性，可以选择中止怀孕。
此外，孕妇应该保持良好的心态，同时注意休息，保证饮食营养的均衡摄入，有助于促进机体恢复。
支原体衣原体感染引起的疾病叫非淋菌性尿道炎，需要使用抗生素进行治疗，用药之前需要进行皮试，到正规性的医院接受诊治。因为具有传染性，治疗期间禁止同房，同时要避免跟家人间接接触感染。
支原体衣原体尿路感染在治疗上主要是针对药敏试验，选择敏感的抗生素治疗。选择敏感的抗生素治疗后，可以是经脉点滴或者是服用，另外，每天穿的内衣服尽量是高温消毒可以热水煮过之后，放在太阳下晒。家里若是有坐便器也要做好消毒工作。平时要注意个人卫生。
支原体可以通过飞沫传播和接触传播感染。
肺炎支原体可以通过飞沫进行传播，如果吸入肺炎支原体患者咳嗽、打喷嚏时喷出的分泌物，就可能会导致感染。另外，如果患者与支原体感染者进行了密切接触，比如不良性行为，就可能会导致感染，建议患者及时就医治疗，不要私自用药治疗。
对泌尿生殖道支原体和衣原体感染治疗、多采用四环素类、大环内酯类、喹诺酮类及大观霉素、克林霉素等抗生素、一般疗程为7～10天.如果细菌培养发现有耐药菌株存在，进行药物敏感试验、以便选择敏感药物进行治疗。
支原体和衣原体感染是一种性传播疾病。女性感染支原体和衣原体后，一方面容易引起非淋菌性尿道炎，另一方面容易引起宫颈炎和阴道炎，出现白带异常、外阴瘙痒等症状。这种现象需要抗生素进行抗感染治疗。在正常生活中，应该注意不要吃辛辣刺激的食物，多吃新鲜蔬菜和水果。
