一般需要住院治疗3—5天，但该时间并不绝对，部分病人可能因基础疾病如糖尿病等引起术后局部感染、恢复较慢，住院时间会相对延长。术后对肛周的护理也可能影响住院治疗的时间。建议患者术后多饮水，避免辛辣刺激食物，避免饮酒。
肛周脓肿手术后发热积极用抗生素抗炎治疗，监测好体温的变化，然后积极进行抗感染治疗，以及做好创面处理，是有利于缓解发热症状，注意定期进行坐浴治疗，每天两次，每次大于半个小时。
有关生化检查要求病人晨起空腹抽血，若检查泌尿、生殖系统，须蹩尿。若采取局麻手术术前正常进食，排空大小便，清洗肛门。手术后2到3天内可以吃一些流质食物（牛奶，果汁，汤），之后可以进食无渣或少渣的食物（米粥，软面条）等。
肛周脓肿是常见的肛周疾病，形成原因主要是继发肛腺或者肛窦感染，也有一部分是局部软组织感染所致。常见症状是肛周疼痛，伴有发热，严重时有寒颤。肛周脓肿急性期应及时手术切开引流，术后定期换药，保持引流通畅，便后熏洗坐浴，抗感染治疗。术后发烧建议首先要积极做好个人卫生，及时进行抗炎药物对症治疗观察看看，必要时结合解热镇痛药物治疗就可以的。
肛周脓肿手术后早期伤口渗出较多，应禁食辛辣性食物，因这类食物中的刺激成分不会被人体完全吸收，再次刺激伤口，导致伤口疼痛。需要在术后适当补充水分，多食蛋类或肉类等富含蛋白质的食物。
肛周脓肿分为皮下和高位脓肿，皮下的肛周脓肿不需要挂线，如果肛周脓肿的内口超过了肛管直肠环则需要挂线治疗，因为直接切断肛管直肠环会引起大便失禁。挂线则可不切断肛直环而使脓腔愈合，同时也有引流炎性渗出物的作用。