甲状腺穿刺会有一些副作用。具体副作用如下：
1、可能会疼痛。甲状腺细针穿刺引起的疼痛虽然轻微，但由于一定的心理障碍，患者会感觉疼痛非常严重。
2、流血，侵入性细针穿刺可能导致出血。比如在进行甲状腺细针穿刺时，由于甲状腺组织比较脆弱、较薄，穿刺后可能容易出血，出血后也非常容易感染，所以这是临床上比较常见的副作用之一。
3、甲状腺细针穿刺的副作用也要考虑准确性。例如，小于1cm的甲状腺结节在穿刺时经常定位不准确，这可能导致错误或无法检查所需的病理结果。
羊水穿刺是产前检查的一种方法。需要用穿刺针刺破羊膜腔，抽取羊膜腔内的羊水。是安全的，对母体和胎儿均不会造成伤害，但也存在一定的危险性，的并发症是导致胎儿流产，不会超过1%，在B超下做正确的羊水穿刺将避开胎儿。这样对孩子造成的损伤就更小了。
穿刺过程当中，病人出现疼痛，虽然是在麻醉支持之下，但是病人在整个过程当中都是有感觉的。也容易出现穿刺所导致的副损伤，常见的是出现皮下血管或者神经损伤，严重的还会出现血肿形成。
肝穿刺检查主要用于各种肝脏疾病的鉴别诊断，如了解肝脏病变的程度和活动性，鉴别黄疸的性质和产生的原因，提供各型病毒性肝炎的病原学诊断依据，发现早期、静止期或尚在代偿期的肝硬化，判别临床疗效。
羊水穿刺是指孕中晚期用穿刺针经腹壁子宫壁进入羊膜腔取羊水，供临床分析、诊断或向羊膜腔注药而选用的诊疗手段。
羊水穿刺可应用于孕期检查产前诊断或羊水过多或羊水过少，亦可应用于引产。需结合患者具体情况选择是否需接受该项检查以确诊和治疗。再进行羊水穿刺后，患者要做好个人护理，保持局部清洁干燥，避免挤压局部皮肤导致皮肤感染。
