引起唇腭裂的原因当属遗传因素，从遗传方面来讲，有兔唇，也就是唇裂的患者，在其直系亲属或者旁系亲属中是能发现类似畸形的发生的，这就是说它与遗传相关的原因，有遗传学研究认为唇裂属于多基因遗传性疾病。从环境方面来考虑，在妊娠的前三个月中，当母体的生理状态受到侵袭或干扰时，是可能影响到胚胎颌面部的生长发育的，比如准妈妈缺乏营养，不忌烟酒，或者受到一些物理损伤等，都可能造成影响。
唇腭裂是母亲在生长发育过程中一些不利因素造成的。这些因素可归纳为遗传因素和环境因素两大类，临床实践中经常发现唇腭裂患儿，在其直系或旁系亲属中，也有类似的畸形，这是由于某个基因的突变造成的。环境因素指的是胚胎生长发育的环境。母体是胚胎生长发育的温床，如果母体受到外界的干扰，就会影响胚胎发育。
遗传因素，唇腭裂的患者往往在其直系或旁系亲属中也可发现类似的畸形。营养因素，各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生。感染损伤，内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形。孕妇频繁接触x线或微波等，都有可能引起胎儿发育异常而导致唇腭裂的发生。有研究表明，吸烟饮酒也会造成胎儿唇腭裂的发生。
发育畸形做了引产，现再次怀孕，患者因有胎儿畸形发育史，本该要做常规的孕前检查，查找引起胎儿先天发育不良原因，但患者还没来得及做。不能确定是否再次发育畸形可能。引产后两个月又检查出怀孕，子宫内膜还未修复好，土地太贫瘠，有可能导致胎儿发育不良，流产可能。患者引产后未积极避孕，产后没多久就怀孕。
hcg一般指人绒毛膜促性腺激素，怀孕人绒毛膜促性腺激素翻倍慢的原因有异位妊娠、胚胎发育不正常、卵子的质量差等。
孕妇第二次做人绒毛膜促性腺激素检测，人绒毛膜促性腺激素翻番比较慢，可能是因为受精卵没有在子宫里着床，而是在输卵管里生根发芽，导致了异位妊娠，因为没有良好的生长条件，所以胎儿的人绒毛膜促性腺激素并没有增加。第二种情况是因为自身的胚胎发育不正常，或者是卵子的质量差。