可在病变的龟头，包皮上取材镜检或培养可找到念珠菌，滴虫性龟头炎可在分泌物上找到滴虫。或是直接镜检这种龟头炎的检查是刮取阴茎龟头、冠状沟或包皮处皮损表面鳞屑作为待检标本。
滴虫性尿道炎是男性比较常见的，可以观察一下尿道有没有烧灼痛而尿道口处痒感，或者伴有尿频、尿急、尿痛的现象，也可以取新鲜的尿道分泌物做镜检可发现活动的毛滴虫，也可以做一下膀胱尿道镜检查。
滴虫性外阴炎需要取阴道分泌液用悬滴法检查，在镜下可找到活动的滴虫，在染色涂片中亦可见到。必要时可进行培养。滴虫感染时影响阴道细胞，应注意与恶性肿瘤鉴别，必要时可于治疗后作阴道细胞学检查。
应该检查阴道分泌物，白带的检查就是可以检查出来是否有阴道滴虫病，生理盐水悬滴法：这是最简便的一种检测方法，取分泌物与已滴在玻璃片上的少量温生理盐水调和、镜检，显微镜下可以见到呈波状运动的滴虫及增多的白细胞被推移。此方法的敏感性60%~70%。
滴虫性阴道炎最常见的检查项目是阴道分泌物，还有阴道分泌物涂片镜检、组织病理学检查等，除此之外还有尿常规、血常规检查，也是滴虫性阴道炎要做的检查，查看病菌传染源头。
滴虫感染时影响阴道细胞，应注意与恶性肿瘤鉴别，必要时可于治疗后作阴道细胞学检查。取阴道分泌液用悬滴法检查，在镜下可找到活动的滴虫，在染色涂片中亦可见到。必要时可进行培养。