是由于部位的肌细胞被大量胶原纤维分离，失去了正常的排列，不能有效地传递来自起搏细胞的电活动，阻断了正常蠕动的传送。先天性肾积水大都是因为机械性梗阻导致的。
肾囊肿和肾积水是肾脏部位不同的两种疾病，囊肿是肾脏内部出现了液体的肿块，有些是比较小的会慢慢消失，有些会逐渐增大，而肾积水大多是肾脏受到了感染，或者是患有结石，导致尿液堵塞难以排出。一般肾积水的话会明显感觉到腰部两侧的疼痛感，而囊肿则没有。
肾积水考虑是由于输尿管的结石，输尿管的狭窄或者是肿瘤等问题引起的，必须进一步的检查增强的泌尿系统的CT检查，或者是输尿管镜的检查，明确原因再针对性的治疗。如果是输尿管的狭窄，可以通过做输尿管狭窄的扩张手术治疗的，如果存在泌尿系统的结石，可以口服一些排石的药。
肾积水分为原发性和继发性两种，原发性肾积水的原因大多是由于先天肾盂输尿管连接部狭窄而造成的梗阻，或者是血管异位、纤维条索和输尿管肾盂的高位插入。而继发性肾积水则多是由于泌尿系的其他疾病所导致的，如上尿道梗阻性病变、结石、肿瘤、息肉、结核、肾下垂等。
胎儿肾积水多为发育过程的常见现象。
胎儿肾盂积水一般是先天性原因引起的，如果胎儿在子宫内发育，通过彩超检查发现胎儿有肾盂积水，可以定期观察，等胎儿娩出后排除畸形，等胎儿发育正常后，大部分积水患者都会逐渐恢复正常。如果在出生后的半年内，积水还没有消失甚至加重，就必须去小儿泌尿外科就诊。孕妇一般不用过于担心。
导致胎儿双肾积水，通常是因为遗传基因的缺陷、先天发育不良，比如泌尿系统发育畸形或者狭窄、泌尿系统等因素感染所致。如果孕妇患有高血压、糖尿病、心脏病、肾炎或者其严重疾病，那么就可能导致胎儿出现肾实质萎缩和肾功能不全。目前，胎儿时期要想知道积水原因还不是很好，只能经常复查，知道积水的具体范围，及有无加重倾向，由此判断积水是否会损伤肾脏功能。
此外，临床上可通过尿液检查来观察到肾功能异常及有无其疾病。出生后积极救治。
