一般来说，三个月宝宝大便有血丝有黏液，通常是肠道受到了影响。细菌感染之后会引起肠道粘膜的破损，从而造成肠道粘膜的分泌增多，从而产生了大量的血丝和粘液。粪便检查包括白细胞、脓细胞、红细胞等。也不能完全排除是由于病毒感染引起的肠道粘膜受损和出血。可以在医生指导下使用蒙脱石粉，可以起到保护肠道粘膜的作用。
此外，宝宝大便有血丝有黏液期间应该避免吃生冷、油腻、辛辣的食品，有助于改善症状。
通常情况下，3个月的宝宝大便有黏液是因为宝宝较小，消化系统发育不完善，容易受环境因素影响，母乳喂养的母亲饮食方面不合理等，可能会导致消化不良症状发生。如果冬季的室内温度低、夏季开空调，而宝宝的穿着过于单薄，容易出现大便有黏。母乳喂养的妈妈如果进食生冷、辛辣、刺激的食物，人工喂养的宝宝配方奶粉比例不合理等。
另外，小儿急性肠胃感染也可能导致症状出现。建议家长调理脾胃功能，平时要注意加强对宝宝的护理。
一般情况下，宝宝大便有黏液可能是以下原因导致的：
宝宝大便有黏液，这种情况一般都会引起父母的关注，一般情况下，肠道内会有少量的液体，但是并没有表现出来，所以要引起父母的重视。建议父母拿到尿样，到有粘液的地方进行化验，检查是否存在感染，也可以使用益生菌进行调理。检查粪便没有发现病菌，宝宝大便有黏液可能是感冒引起的，还有可能是由于吃了什么东西对身体造成的影响，从而引起宝宝大便有黏液。因此，需要进行相关的检查，确定病因后对症治疗。
宝宝吃奶后大便颜色为黄色或金黄色，一天2-4次，多则7-8次。正常情况下，大便中会有少量粘液，这是肠道粘膜的正常分泌，由于与大便的比例均匀，所以不容易被发现。
宝宝大便中有粘液是由消化道疾病引起的，如肠炎、痢疾等，大便中除了有大量的粘液外，还伴有血丝、阵发性腹痛等，要考虑是否是肠套叠、肠梗阻等。所以，如果发现孩子大便有粘液，可以通过化验粪便常规来确定是不是粘液便，还要结合孩子的身体症状和精神饮食情况，及时就医。
一般情况下，宝宝大便有黏液和奶瓣可能是消化障碍、饮食不当、肠炎等原因导致的。建议及时就医，查明病因，对症治疗。具体情况分析如下：
若婴儿有明显的粪便及乳汁，若无其它异常，则应怀疑是由于消化障碍所致。比如孩子有一些特别的食物，比如给孩子喂奶，比如母亲的食物有什么特别的，可以通过合理的膳食来调节。另外，还可以通过服用一些有益的益生菌来调节肠道的微生态。此外，还要进行大便常规的检测，以确定是不是有细菌和过敏性肠炎。出现明显的细菌感染时，可以适当应用一些抗生素。如果日常中出现了红细胞和潜血的情况，那么就应该注意是否存在可疑的过敏食品，避免接触。
如果宝宝大便中有明显的泡沫和粘液，可能是消化不良的表现。如果在症状较为严重，需要到医院做便常规检查，排除粘液部分是否存在细菌感染。出现泡沫是否因为乳糖不耐受。母乳喂养的宝宝大便泡沫较多时，需要注意糖分摄入，如甜点、含糖饮料、葡萄、南瓜等。另外做便常规时要观察是否存在红细胞、潜血等情况，排出胃肠疾病影响，保证宝宝身体健康。