口腔溃疡首先查明病因，创伤性溃疡，有些活动义齿或者突出的牙尖长时间磨口腔黏膜会导致溃疡发生。可以去除不良修复体，磨去尖锐的牙尖去除刺激，溃疡会很快消失。近期抵抗力变弱或上火原因导致溃疡发生，可调整心态或吃些药物提高免疫力。避免溃疡发生。溃疡原因不明，需对症处理上止痛的糊剂或喷剂。一般溃疡两周即可好转如不好转及时治疗。
可以局部涂抹软膏来进行治疗，几天时间，可能就会好了，建议每天晚上一定要清洗，做好干净。如果包皮过长，就要去医院，割掉的。发生不洁性生活以后出现包皮内溃疡，很可能是与感染性病有一定关系，检测工作必须做好，必须弄清楚，病原体是什么，才好得到有效治疗？仅仅从溃疡症状表现无法确认，可能是淋病或者梅毒造成的不同病因及治疗用药是不一样的，盲目的使用药物很可能会加重症状，造成新的感染。
尽量不要挑出来，因为口腔溃疡形成的主要原因是病人体能透支和营养失衡。此时，如果内热过多，口腔溃疡的发生率将进一步加快。这时，病人的身体抵抗力差，愈合能力也将处于较低水平。因此，如果此时水泡被刺破，只会加速口腔溃疡的炎症，给身体带来更多的不良影响。
长口腔溃疡，考虑是由于自身免疫力低下，从而使细菌进入体内引起的。经常锻炼身体，增强体质，平时多吃蔬菜水果，适当的补充维生素c，也可使用水进行局部冲洗，注意局部卫生，也可去医院口腔科进行洗牙治疗，平时规律作息。
可以服用消炎去火的药物治疗，口腔溃疡是一种以周期性反复发作为特点的口腔粘膜局限性溃疡损害，可以自己好，可发生于口腔粘膜的任何部位，以唇、颊、舌部多见，严重者可以波及咽部粘膜。
口腔溃疡患者不可以将维C放至溃疡处，维C为口服药，与局部用药不同，且口腔黏膜与胃部黏膜不同，维C放至溃疡处对口腔黏膜有腐蚀性，可加重病情。维生素对口腔溃疡没有明显治疗效果。
