乙型疫苗全程接种按照0，1，6个月程序，即接种第1针疫苗后，间隔1及6个月注射第2及第3针疫苗。新生儿接种乙型肝炎疫苗越早越好，要求在出生后24h内接种，新生儿的接种部位为大腿前部外侧肌肉内，儿童和成人为上臂三角肌中部肌肉内注射，单用乙型肝炎疫苗阻断母婴传播的保护率为87.8%。
乙肝疫苗第一针与第二针最长能间隔1个月，这是相对比较常见的注射手段和方式，打三针是产生抗体效果好的时期。乙肝疫苗是第1天注射间隔一个月6个月分别打一针，总共打三针，这是相对比较常见的。
第二针乙肝疫苗接种时间在一个月的时候接种，第二针六个月的时候接种第三针。第一针疫苗和第二针疫苗，主要是起到产生抗体的作用，应是不要推迟，第二针疫苗推迟的话也不要推迟超过一周。按时间去接种相关疫苗。
正常足月出生的新生儿，生后24小时内要接种乙肝疫苗第一针；一个月龄时要接种乙肝疫苗第二针；六个月龄时要接种乙肝疫苗第三针；每次五微克。如果母亲是乙肝病毒携带者，生后六个小时之内要肌内注射高价乙肝免疫球蛋白100-200IU，同时更换部位注射乙肝疫苗10微克。如果母亲乙肝DNA定量阳性，那生后半个月的时候，要重复注射相同剂量的乙肝免疫球蛋白一次。
打第二针乙肝疫苗有不良反应考虑是短暂的炎症反应，有的人可在接种部位发生轻度的红、肿、热、痛的炎症反应，有的人还可能出现局部淋巴结肿大或淋巴管炎。不良反应在48-72小时消退。
第一针和第二针疫苗最晚不要超过48天，接种乙肝疫苗要按照规定的时间接种，不可以提前接种，但可以稍微延后接种，种第一针乙肝疫苗之后可以产生一定的抗体，后面的两针是加强针，间隔的时间太长，不利于乙肝表面抗体的形成。
