一般情况下，引起儿童矮小症原因如下：
一是由于骨骼发育疾病、性早熟、骨代谢病、染色体相关疾病、生长激素缺乏症、侏儒病、先天性甲减、宫内发育迟缓引起的矮小症。第二种是短期矮小症，主要是心理因素造成的，其次是后天营养不良，蛋白质摄取不足，长期睡眠质量不能保证也会抑制生长激素分泌，从而导致矮小症，发现之后应尽早治疗。
很多家长关注孩子身高，会带孩子体检，孩子比其他儿童矮很多时，会担心孩子长不高或有矮小问题。带孩子检查时建议到儿童保健科或小儿内分泌科检查。
若发现孩子身高有问题时，身高明显低于正常同龄儿童，建议到医院儿童保健科的生长发育门诊或小儿内分泌科检查，两个科室都能看儿童矮小症。即使孩子没有达到矮小症标准，身高偏矮时也可以在这两个科室获得促进身高发育的知识。
儿童矮小症需要做的检查如下：
第一步，要做全身检查，首先要做的就是测量孩子的身高、体重，然后和正常的小孩做比较，看看是否达到了标准值。第二，询问患者的病史，比如家长的身高，这也是影响孩子身高的一个重要因素，根据基因的不同，可以考虑到孩子的基因身高。第三，需要做一些相关的化验，比如生长激素、甲状腺功能、肝、肾、血常规等，以找出导致儿童矮小症的原因。第四，通过拍骨龄来确定孩子的骨龄。第五，核磁共振是一项重要的检查，以确定是否存在脑垂体肿瘤。
儿童患上甲减通常不是矮小症。
矮小症是指身体中缺乏生长因素,导致身材矮小的疾病.矮小症多数是由于患者身体出现某种疾病或是遗传基因导致的。甲状腺低下并不是矮小症，但是如果不及时治疗的话，身高会比正常的孩子矮小，差距会越来越大。如果甲状腺激素缺乏，那么生长激素对身高的促进作用就会减弱，生长激素是一种促进身高的物质，在缺乏生长激素的情况下会导致身材矮小。
儿童矮小症表现为患儿身高较同性别，年龄偏低、同族孩子平均身高超过2个标准差，或者孩子年生长速度小于五厘米。
一般情况下，在正常范围内生长的人，不会出现任何问题。如父母发现，自己的子女在全班同性别子女中，身材最矮小，或儿童年生长高度低于五厘米，要考虑到儿童可能有生长障碍。如果症状比较严重，需要及时就医检查，排除相关疾病。