骨囊肿是一种良性的疾病，可能会自行消失。
一般情况下，骨囊肿内部有淡黄色的液体，有些骨囊肿较小，会自行消失。有的骨囊肿较大，不能自行消失。患者要定期进行X光检查，以确定是否有骨囊肿的改变，如有改善，则X光检查可见骨修复的情况。还需要观察患者是否出现局部疼痛，需要进行X光检查，明确病情，必要的时候可以做石膏固定。
骨囊肿有很多种，绝大部分骨囊肿是良性的，一般没有任何临床表现。如果囊肿小的话，没有任何表现，如果囊肿长大了，可以发生骨骼膨胀变形。再就是机械力度下降，在受力的剧烈运动的时候负重的时候会感觉患部的疼痛。可能某种意外用力，因为骨骼的力学结构发生了改变，会导致病理性骨折，才发现有骨囊肿。骨囊肿绝大部分都是良性，经过及时的处理，刮除治疗固定可以完全恢复，恢复到完全正常。
骨囊肿属于骨骼的良性病变，自愈的可能性小。骨囊肿可能表现为骨骼局部的凸起包块，有的伴随轻微疼痛不舒服，有的也可能没有明显症状。可以通过骨骼X片检查判断骨囊肿的部位和大小。对于骨囊肿的治疗选择局部手术刮除，如果骨囊肿较大，必要时植骨内固定治疗。
诊断出股骨骨囊中后尽早在医生建议下进行手术治疗。
股骨头囊肿是由于局部损伤，或股骨头血管栓塞，引起股骨头血运减少，并出现股骨头囊性变，后期形成囊肿。如不进行及时治疗，严重会导致骨皮质破坏，骨破坏局部增强，最终会造成病理性骨折；囊肿如果与软骨下骨距离较近的话，会引起股骨头塌陷，因此需通过手术将囊肿部位切除并在其部位充分植骨，以生成正常骨组织。
术后患者需避免运动，保持创口的干燥和卫生，保持正常作息，便于恢复。
通常颌骨囊肿可不以自愈。
颌骨囊肿可能不会出现明显的临床表现，也不需要特别的处理，只要坚持做好常规的检查和观察就可以了。但是部分患者患有下颌骨囊肿后，会出现面部肿胀、面部畸形、牙齿位移等情况，伴随局部有疼痛不适，要及时进行外科治疗。术后要注意伤口的干净，同时要及时更换药物，并尽量不要接触到水分，伴有感染时可遵医嘱用药治疗。
