扁平疣冷冻以后可能会出现局部的痕迹，但是不会有斑痕。患者可以局部去询问医生涂一些相关药物来消除一些。同时应该注意局部的卫生，以免引起感染。不要过度紧张，平时注意多休息，避免熬夜，饮食清淡点，多吃新鲜瓜果蔬菜。
一般情况下，凸起的疤痕可以通过一般治疗、药物治疗、激光治疗等方式去除。
1.一般治疗：由于受到纤维组织过度增生的影响，局部可能形成凸起的疤痕。为抑制或去除疤痕，患者可以在医生指导下使用弹力绷带、压力服等物品，若疤痕位于面部，还可以选择加压面罩，通过外力压迫来防止疤痕持续增大。
2.药物治疗：如果局部皮肤可见明显凸起的疤痕，患者可以在医生指导下使用复方醋酸地塞米松乳膏、曲尼司特胶囊、多磺酸粘多糖乳膏等药物，防止疤痕持续增生，以改善疤痕状态。
3.激光治疗：如果凸起的疤痕位于颜面部、手臂等易露出位置，患者可以考虑接受激光治疗，通过激光的光热作用来破坏疤痕组织，促进皮肤修复，以去除疤痕。
如果外伤后不到半年，暂时不需要处理局部的瘢痕。平时注意多吃些富含维生素c和维生素e的食物，避免辛辣刺激饮食，不要搔抓刺激患处，避免阳光暴晒。半年以后如果没有明显效果可以进行微晶磨削。
疤痕去除，年内的新鲜疤痕，先用外用药物医治，年以上的陈旧性疤痕，用药效果就比较差了，时间越久的疤痕，用药效果越差，这时药物是为别的医治方法的辅助而配合使用。疤痕去除需要看疤痕的情况，如果疤痕较浅，也可以采用激光医治。如果疤痕较深，面积大的话，可以考虑手术医治。搭配药膏涂抹，总体是有效的。
其实冷冻治疗会不会留下疤痕还是因人而异的，每个人的冷冻的情况和程度都是不一样的，要是比较浅的情况下就不会留下疤痕的，而且还和个人的体质也有一定的关系，如果处理的不好，后期还是可能会留下疤痕的。