首先畸胎瘤是肿瘤，是恶性的肿瘤。而巧克力囊肿是有良性的。去正规专科医院或正规医院专科诊断做个四维彩超，详细检查，对症治疗，遵医嘱，仔细配合医生治疗。平时多休息，锻炼身体，提高免疫力。不要乱用药。
宫内孕和宫外孕的有以下这些区别。
1、胎儿生长位置不同，宫内孕是指胚胎生长在了正常宫腔内，而宫外孕是指胚胎生长在了正常宫腔以外的地方。
2、危害不同，正常宫内孕一般能坚持到足月自然分娩，而宫外孕绝大部分由于附着的部位营养不够，会导致流产，胚胎组织也可能会对异位的器官造成破坏，可能会导致大出血甚至会危及患者的生命。
3、症状反应不同，宫内孕恶心、呕吐症状比较明显，宫外孕恶心、呕吐的早孕反应不明显。
宫内孕和宫外孕的区别有怀孕的位置不同。宫外孕是指孕囊的着床位置在子宫腔以外，比如输卵管、宫颈、宫角或者盆腔脏器、腹膜等。宫内孕，是指病人的孕囊着床位置是在子宫腔以内，着床在子宫内膜。结局不同。宫外孕病人是没有办法继续妊娠的，如果治疗不及时，会出现大出血，危及病人的生命。
早孕与宫外孕症状差异不大。
如在怀孕后，检测中发现血中人绒毛膜促性腺激素增高，若为宫内孕，通常在1.7~2天内加倍，但若在宫外孕后2天内，通常不加倍，即血中HCG增长缓慢。此外，宫外孕早期易有少量阴道流血现象，关于怀孕症状，早孕时通常35天后有明显恶心现象、呕吐或困倦、不思饮食等，这些早孕反应表现。如果是妊娠晚期，这种情况就非常严重了，因为这时孕妇身体已经开始变得虚弱，而且还会有贫血现象发生。宫外孕是因血中人绒毛膜促性腺激素含量相对较少。
畸胎瘤是来源于卵巢的生殖细胞，囊性的成熟的畸胎瘤是良性的，还有一种是恶性畸胎瘤，也就是含有恶性成分。人体胚胎发育过程中，有一种具有多能发展潜力，多能细胞正常胚胎发育，发展和分化成个胚层的成熟细胞。如果在胚胎不同时期，某些多能细胞从整体上分离或脱落下来时，细胞基因发生突变分化异常，从而导致胚胎发生异常，当脱落发生在胚胎后期时，会形成异常分化的组织，从而形成畸胎瘤。
畸胎瘤和巧克力囊肿是两种来源不同的肿瘤和囊性病变，畸胎瘤是卵巢生殖源性肿瘤，巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢上，随着子宫内膜的周期性出血，血液不能排出而形成的囊性病变，二者治疗均应通过手术切除，而且两者，绝大部分都是良性的，畸胎瘤有可能有恶性的。
