一般情况下，肠道功能紊乱的治疗方法有药物治疗、生活护理来改善，具体内容如下：
出现腹胀、便秘、腹痛、腹泻、呕吐、恶心、反酸等情况时，可以使用胃肠的动力性药物，如莫沙必利、多潘立酮等，促进胃肠的运动。口服甲氧氯普胺能起到一定的抑制肠道蠕动的作用，如果出现严重的腹泻症状，可以口服药用次碳酸铋、黄连素片等。还可以调整肠道菌群，例如地衣芽孢杆菌、双歧杆菌、乳酸菌素片等。
一般情况下，肠功能失调会导致便秘，表现为便忽干、忽稀、排便和排便量不稳定，会有肠鸣、腹泻、上腹部疼痛、反酸、嗳气、厌食、恶心、呕吐、灼热感、进食后会有饱胀感等。一般发病比较慢，病情往往会随着时间的推移而加重，如果长期存在，或者是反复的发作，需要在医师的建议下服用氯丙嗪、抗胆碱能药物、维生素B6等药物，建议患者在医生的指导下使用药物进行治疗，以免对身体造成不良影响。
一般情况下，肠道功能紊乱可以用解痉镇痛药物治疗法、营养支持疗法，以及饮食疗法治疗，需要对症治疗。具体分析如下：
通常来讲，肠道功能紊乱可以使用阿托品、普鲁本辛等解痉止痛药治疗，使平滑肌松弛，从而改善肠道功能紊乱。如果伴有神经性呕吐，可以服用维生素B6，呕吐比较严重者可服用多潘立酮片、异丙嗪等药物治疗。而对于具有明显精神症状的患者，应以抗抑郁或抗焦虑药物治疗为主，解除患者的心理障碍，让患者有战胜肠道功能紊乱的信心。需注意的是，所有药物要在医生指导下服用。
肠道功能紊乱可以采取以下办法缓解。
治疗肠机能失调时，要注意不要诱发因素。如果吃了海鲜引起的肠胃机能失调，就需要尽量少吃高蛋白质的食品。如果病人在喝酒后出现腹泻、腹痛等症状时，一定要注意不要吃辛辣刺激的食物。另外，还要有合理的膳食结构，调整身体和心理，防止过度的心理和心理的紧张。肠道功能失调是一种心理疾病，肠道的感觉神经过于灵敏会导致肠功能失调。
一般情况下，肠道功能紊乱可以吃香蕉、南瓜等，具体分析如下：
1、香蕉富含纤维，口感细腻，不会对胃肠道造成任何的刺激，同时也可以中和胃酸，调整肠胃的机能；
2、多汁的水果，富含果胶、纤维素、维生素等营养成分，既可促进排泄，又可促进肠道中的有益微生物，使肠道的机能恢复；
3、富含糖类和果胶的南瓜，能够吸收消化道中的有害物质，保持肠粘膜的正常运作。
一般情况下，肠道功能紊乱可以自愈。具体分析如下：
通常来讲，肠道功能紊乱又称为胃肠神经官能症，病因为精神因素、饮食不规律，或者是患者的压力过大等。如果患者各项消化道检查没有发现器质性病变，可以尝试着自我调节调节情绪，日常多食新鲜蔬果，适度锻炼，早睡早起，保持良好作息，保持心情的舒畅，一般肠道功能紊乱是可以自愈的。