手指甲上有小坑多考虑有真菌感染，继续发展下去，指甲会出现灰指甲等真菌性甲藓。可以外用药，有脚气的话，早点治疗脚气，避免用手指甲接触有脚气的脚。避免吃辛辣油腻刺激性食物，不要吃海鲜和牛羊肉。
手指关节疼痛，有以下原因：
一、类风湿性关节炎，这是一种自身免疫性疾病，主要表现为手、足部位的小关节疼，这种关节的疼痛表现为双手、双足的对称性疼痛，出现手、足关节部位肿胀、疼痛，晨起活动时手指关节发皱、僵硬等症状。
二、手指关节部位退变、骨质增生，也会导致手指关节在活动时出现疼痛、局部肿胀、压痛等现象，但这种疼痛是单手或单根手指出现的，不会出现对称性手指关节疼痛。
手指不能弯曲，可以局部热敷按摩，适当屈伸手指康复功能锻炼。可以到当地正规综合性儿童医院就诊检查看看，是否先天性腱鞘炎等情况有关，必要时可以进一步手术治疗恢复。可以母乳喂养加强营养，补充维生素微量元素。
手指长痣可能是疥，是一种传染性的疾病，有可能是这段时间色素过多所导致的良性增生，如果色素过多的话，可能会导致身上出现痣的情况，可以观察一段时间，养成一个良好的习惯。
考虑宝宝是身体里缺乏微量元素钙铁锌等，也有可能是室内空气干燥引起的，日常生活中要保证宝宝营养均衡，适当的添加副食，比如鸡蛋，牛奶，苹果，香蕉，牛肉，羊肉等食物，加强对宝宝的看护，注意保暖，避免着凉。这可能是缺乏微量元素的，可以做下检查再进行补充的。
如果手指甲有横向凹陷，可能是因为缺钙的原因，一定要及时的进行补钙，平时的时候也要多做一些户外的运动，因为多晒太阳也是具有补钙的作用，在自己的饮食上也可以选择一些牛奶来进行补钙，因为一般正常的手指甲的颜色都是比较红润，而且是平整的。
