治疗顽固性口腔溃疡，要用效果好一点的溃疡药，另外一定要检查免疫功能，如果说免疫功能比较低下的，也是需要用一些免疫增强剂来帮助提升免疫力，类似于胸腺肽。平时的饮食也一定要注意，不能吃任何辛辣刺激性的食物，也不能吃过烫的食物。
平时多吃蔬菜水果，补充维生素，提高免疫力，可以有效的减少口腔溃疡的发生。反复发作的口腔溃疡可以适当的应用激素类药物进行治疗，平时注意饮食卫生，不要吃辛辣刺激的食物。
口腔溃疡是一种反复发作的、有自愈性特点的疾病，顽固性口腔溃疡就是溃疡面长期不愈合，那需要认真检查一下，包括全身性疾病的检查及局部因素的检查。全身性疾病的检查如是否存在消化系统溃疡性疾病、肝脏疾病，是否存在营养不良，消耗性疾病，神经系统疾病、肿瘤等，如果是以上的因素造成的顽固性口腔溃疡，那么需要治疗这些原发性疾病。
这主要与免疫力低下，维生素缺乏感染有关，溃疡具有自限性，一般7~10天可以自愈，要补充维生素，提高免疫力，可以有效的减少口腔溃疡的发生，反复发作的口腔溃疡可以适当的应用激素类药物进行治疗。
顽固性霉菌需注意个人卫生、饮食习惯，按疗程进行药物治疗达到痊愈。
首先，应改变生活习惯，如袜子和内裤严格分开来洗，洗袜子和洗内裤的香皂也需严格分开。其次，临床症状消失以后，连续三次做白带常规的化验都显示阴性，才可停药。性伴侣应一同治疗，性伴侣不治疗，可能会造成交叉感染，使霉菌一直顽固，达不到治愈的目的。饮食少吃酸辣刺激性食物。少用抗生素，避免引起菌群失调，以上三方面都注意到，可加快顽固性霉菌的治愈。
