治疗轻微性功能障碍，可以选择药物治疗配合物理治疗方法，选择适合自己的药物，再加上用电动按摩器可以促进男性射精，使用振荡器、阴茎模型可增加女性的刺激等方法进行治疗。
性功能障碍应该前往正规医院的泌尿外科认真地检查一下，比如是性激素水平下降引起的，平时应该树立健康的性心理，避免紧张情绪，缓解生活工作压力，多吃点狗肉、羊肉、羊肾等具有补肾功效的食物，以提高性欲，还应加强整体的体育锻炼、多运动。
对于女性，有排卵功能紊乱的治疗措施有改善生活习惯、口服短效避孕药物、促排卵药物等：
1、排卵功能障碍患者需要及时改善生活习惯，多做运动，并能有效地减肥；
2、口服短效避孕药物，比如炔雌醇环丙孕酮片、屈螺酮炔雌醇片、去氧孕烯炔雌醇片等，可以调节月经的周期及高雄荷尔蒙的表现；
3、如果有需要，可以使用氯米芬、来曲唑等药物进行促排卵。
对于不能排卵者，要及时到正规的医院做进一步的体检，以确定其原因，并给予相应的药物治疗。
对于性功能障碍的治疗，首先要找出性功能障碍的类型和诱发因素。只有找到了具体的原因，才可能成为治疗的目标。由每个人不同的身体状况引起的性功能障碍的因素也是不同的，这取决于是精神疾病还是疾病。这一点必须清楚地理解。如果找不到药物，盲目使用是不好的。
性功能障碍主要有阳痿、早泄、性欲减退等。引起这些性功能障碍的原因有很多，首先要做好检查，明确原因，然后选择药物治疗，比如抽血化验性激素水平、阴茎血流多普勒检查、龟头神经敏感度等。如果性激素水平下降，可以服用11酸睾酮胶囊或者金匮肾气丸、八味益肾丸等补肾益气的药物。如果出现阴茎海绵体充血功能障碍，可以服用红景天胶囊、血栓通片等药物，治疗2-4周。如果龟头过于敏感，可以使用盐酸达克罗宁治疗一个月。
治疗中均应首先采用精神心理分析和行为治疗，再依据各种病因进行物理、药物及手术等综合性治疗。继发性性腺功能低下者，多为下丘脑或垂体病变所致。亦可采用促性腺激素释放激素治疗，多用体内埋植生物泵方式，定期以脉冲式释放LHRH，促使睾丸生精上皮的发育和睾酮的合成，提高性欲，恢复性功能。
