附睾囊肿的治疗方法比较多，如果是轻微不适那可以吃一段时间中药来看看效果。但是如果囊肿大，或者出现了严重的并发症等，那一般建议做手术来治疗会比较好，否则会影响到正常的性生活的。
可以通过手术切除囊肿和精索静脉曲张，这样才可以完全治疗的，医生给开药，主要是治疗前列腺炎的情况的，可以继续服用药物前列腺炎的情况治疗后，积极的手术，这样就可以有好的效果的。可以避免造成生育影响的。
一般情况下，附睾囊肿通常不会导致男性出现阳萎，具体情况分析如下：
附睾囊肿是一种囊性疾病，是一种常见的泌尿系统疾病，常发生于人体的附睾，当其体积很少的情况下并无明显的临床表现，但是当其体积逐渐扩大后，会产生阴囊底部的不适。如有感染会出现发热、红肿等症状。阳萎是一种不能勃起、勃而不坚、坚而不坚硬的疾病，也就是所谓的勃起功能障碍。
附睾囊肿是一个生长在睾丸顶端的充满液体的囊。是良性的即非由癌症引起。有些男人只有一个囊肿另一些在两个睾丸上有多个囊肿。很少见的是，可以与引起身体其他部位囊肿的疾病相关联。小囊肿不需要治疗。
附睾囊肿是因为性刺激，或感染因素引起的，也可能是精子的管道不通畅引起的。常常表现为睾丸胀痛，坠胀感。患处常常表现为有肿块。如果症状不明显，没有发展的趋势，不需要治疗。
