双侧多发肾结石并发肾积水首先考虑体外冲击波碎石治疗。要积极治疗肾结石，结石排出后，肾积水一般都会自行消失。小于0.6厘米的结石，口服排石药物治疗，较大的结石可选择体外震波碎石，然后多喝水，多运动，促进结石排出。
肾积水伴输尿管结石可以通过一般治疗、药物治疗、手术治疗来改善病情。
1、一般治疗：当出现肾积水合并输尿管结石时，患者可能会出现恶心呕吐、腰腹部疼痛、排尿困难、血尿等不适，在治疗的过程中要注意多喝水，适当的运动，一般有利于缓解梗阻的情况。
2、药物治疗：建议遵医嘱进行药物治疗，如使用枸橼酸氢钾钠颗粒、碳酸氢钠片等药物，可以碱化尿液，促进结石排出。如果出现了肾绞痛，一般要遵医嘱应用双氯芬酸钠缓释胶囊等非甾体类镇痛抗炎药物。
3、手术治疗：在保守治疗无效的情况下，可积极就医，采用体外冲击波碎石、经皮肾镜碎石术、输尿管镜碎石等方法进行治疗。
及时的去医院做个肾脏彩超或者是尿路造影，有堵塞需要及时碎石或者手术取石治疗。输尿管结石肾积水，影响了新陈代谢，输尿管结石肾积水的治疗要根据结石大小、部位、数目、形状、一侧或两侧、有无尿流梗阻、伴有感染、肾功能受损程度。
肾结石、肾积水、输尿管扩张考虑为肾结石引起肾积水，而输尿管结石导致输尿管扩张，可以通过保守治疗、手术治疗来干预。
肾结石可能导致肾脏堵塞，形成肾结石，但通常并不会引起输尿管的扩张。如果出现输尿管扩张的情况，可能是输尿管结石造成的。而输尿管结石通常是肾结石掉落到输尿管中引起的，可能引起结石的滞留，进而出现肾结石、肾积水及输尿管扩张的情况。如果结石比较小，可以通过使用药物、多喝水来促使结石排出；但如果结石比较大，则需要及时行外科手术，来取出结石。
输尿管结石导致肾积水，建议马上应该到医院进行进一步的检查。应该做B超检查，可以发现结石在输尿管的什么位置、结石的大小、数量、肾积水的程度、输尿管扩张的程度，根据这些做出具体的判断，该怎样进行处理。如果结石小于0.5cm，建议多喝水，吃排石药，可以将结石排出体外，适当的运动，这样结石排出可能会更快。
尿管结石伴有肾积水，提示已出现梗阻性肾病，建议积极排石治疗，尽早解除梗阻。根据结石的大小，可以采取内科治疗和外科治疗。如果结石直径小于0.6cm，一般通过应用解痉的药物，比如654-2，钙离子拮抗剂，多饮水，多运动可以排除体外。如果结石超过0.8cm，就要采取外科治疗，比如体外震波碎石，或者是输尿管镜，或者是开放手术治疗。
