遗传因素，唇腭裂的患者往往在其直系或旁系亲属中也可发现类似的畸形。营养因素，各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生。感染损伤，内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形。孕妇频繁接触x线或微波等，都有可能引起胎儿发育异常而导致唇腭裂的发生。有研究表明，吸烟饮酒也会造成胎儿唇腭裂的发生。
hcg一般指人绒毛膜促性腺激素，怀孕人绒毛膜促性腺激素翻倍慢的原因有异位妊娠、胚胎发育不正常、卵子的质量差等。
孕妇第二次做人绒毛膜促性腺激素检测，人绒毛膜促性腺激素翻番比较慢，可能是因为受精卵没有在子宫里着床，而是在输卵管里生根发芽，导致了异位妊娠，因为没有良好的生长条件，所以胎儿的人绒毛膜促性腺激素并没有增加。第二种情况是因为自身的胚胎发育不正常，或者是卵子的质量差。
唇腭裂的原因主要是各种因素导致的孕妇维生素缺乏都会引起胎儿唇腭裂的发生，另外在怀孕期间孕妇如果内分泌紊乱以及药物因素都会导致胎儿畸形，或是频繁接触x线或微波等都会导致宝宝出现唇腭裂。
引起唇腭裂的原因当属遗传因素，唇腭裂患者其直系亲属或旁系亲属中有类似畸形发生。同时环境因素也是引起先天性唇腭裂的原因，营养因素：营养因素也是一种比较严重的原因，很多孕妇在怀孕期间会出现呕吐的情况，之后会有不同程度厌食的情况，这时胎儿摄入的营养是不足的，所以造成维生素缺乏，在动物实验中，用缺乏维生素A、E的食物喂养怀孕小白鼠时，出生的幼鼠常有唇腭裂发生。
唇腭裂是口腔常见的先天畸形，发病率约为不高。在一个正常的胎儿中，在生命的第五个星期后，几个胚胎突起逐渐融合在一起形成面部，如未能正常发育便可发生畸形，其中包括唇裂。孕妇在怀孕期间应避免偏食，保证维生素B，C，D及钙，铁，磷的充分摄入，保持心境平和，避免精神紧张。
唇腭裂是一种先天性发育畸形，是指胎儿在发育过程中，由于受到某种因素的影响，使各胚突的正常发育及融合受到了影响或者阻挠。唇裂的原因是由于上颌突和球状突的融合受到了干扰导致。腭裂的原因是由于中腭突没能和侧腭突相融合导致。
