咖啡斑的治疗主要包括激光治疗、家庭护理等。
1.激光治疗：咖啡斑是一种较常见的色素沉着性皮肤病。激光治疗咖啡斑的原理是利用激光的光电效应将皮损内的黑色素进行破坏，从而达到治疗的作用。
2.家庭护理：平时要注意保持卫生，加强皮肤清洁，避免过度摩擦搔抓。平时要注意防晒，避免阳光直射，外出可戴太阳帽或打太阳伞，外用防晒产品。
牛奶咖啡斑有可能会根治，要根据病情的严重程度进行判断。
咖啡斑如果不是特别的严重，面积比较小，而且色素也比较轻，在经过治疗以后通常能够完全的根治。但是如果咖啡斑的面积比较大或者是色素比较重，在治疗的时候也有可能会有少量的残留，没有办法完全的根除，需要尽早进行治疗，能够预防色斑加重。
咖啡斑可以通过光子嫩肤的方法进行治疗，通常是利用特定的宽光谱彩光照射在皮肤表面，能够选择性的将皮下的色素细胞分解，从而有效的去除色斑。
咖啡斑多数需要治疗，具体根据自身实际情况诊断。
咖啡斑颜色比较浅或者面积较小，多数不会导致美观受到影响，不需要特殊治疗，但要做好防晒，不能受到强烈紫外线照射，以免导致颜色加深或者面积增大。如果咖啡斑比较严重或者咖啡斑面积比较大，会对面部美观造成很大影响，还会打击到个人自信心，因此需要治疗。
去除咖啡斑可选择激光祛斑，利用性光热原理瞬间爆发巨大的能量，作用于色素组织，能够将色素击碎或者分解，被巨噬细胞吞噬掉，从而可以随着自身淋巴系统排气排出体外，达到祛斑作用。
一般来说，“哪里治疗咖啡斑最好”的说法并不严谨，通常患者前往正规的医疗机构治疗咖啡斑比较好。具体分析如下：
咖啡斑是数毫米至数十厘米大小不同的浅褐色、棕褐色至暗褐色斑块，皮损通常呈圆形、卵圆形或形状不规则，边界清楚，表面光滑。通常患者前往正规的医疗机构治疗咖啡斑比较好，患者可以选择冷冻治疗的方式进行处理，该方式主要是借助液氮将病损皮肤冻伤，进而使其脱落，从而去掉皮下的咖啡斑。
此外，患者术后应该注意护理，以免出现感染的情况，进而不利于皮损恢复。
咖啡斑，是神经纤维瘤病患者的一个重要表现，对于神经纤维瘤病患者，常会表现为体表有多发的咖啡斑，一般咖啡斑的数量会达到六个以上，咖啡斑的最大直径，在青春期之前达到五毫米以上，青春期以后达到15毫米以上，同时患者体表可以有多发的神经纤维瘤，在他的椎管内和颅内，也可以发生多发的神经纤维瘤，或者神经鞘瘤，从而出现患者一系列的神经根痛、肢体肌力减退，甚至肢体的肌肉的无力、肢体的瘫痪，乃至截瘫、大小便失禁等。
可以使用激光来治疗咖啡斑，激光去除咖啡斑每次治疗间隔2—3个月，激光对咖啡斑有着格外明显的作用效果，对病变组织较浅的咖啡斑可以一次治愈，病变组织较深的咖啡斑一般也就3次左右，且没有任何副作用，不留疤痕。
