先天性巨结肠手术后大便次数增多或失禁或胀气，说明手术创面没有完全恢复正常，肠功能比较紊乱，肠道还有炎症存在，口服消炎药，严重的情况可以进的抗生素治疗，局部热敷或者烤电，尽量多喝流质和热粥，不要吃太硬太干太凉的食物，不要吃的太饱，做到少吃多餐比较好。
巨结肠的宝宝一般以顽固性便秘为主要症状，数日至数周之后排便一次。以后便秘愈来愈严重，腹部明显膨胀，胀得肚皮又薄又紧，甚至皮下青筋突出，腹大如鼓。患儿常常哭闹不安、拒食、呕吐，灌肠或服用泻药后，可伴有较多的气体和粪便排出，腹胀随即减轻，但过后便秘又复如初。
胃肠功能不好，造成了大便次数少的表现。孩子情况需要按摩腹部刺激胃肠蠕动，来进行治疗，调理肠道的有益菌群让大便恢复正常。这与日常生活中饮食习惯及精神状态有关系。在日常生活中家长可以给宝宝多吃些新鲜水果和蔬菜，如香菇，苹果还有香菇芹菜之类的粗纤维食物。同时多给宝宝喝点水和蜂蜜水。不要吃辛辣刺激性食物，多领宝宝出去走走。
婴儿巨结肠手术后初步的恢复要一周时间，但完全恢复可能要半年以上，术后需要一段时间的禁食水至排气，一定给他吃一些比较清淡的饮食，然后主要是进食流质饮食，尤其的饮食要避免辛辣食物。
巨结肠手术治疗的后遗症和并发症较为常见的为肠梗阻，排便功能障碍，肠瘘，吻合口狭窄等。并且后遗症的概率是随着年龄的增大而变大，因此在发现巨结肠后要及时的进行手术治疗。
一般来说，如果经常出现大便次数多的情况，首先考虑就是饮食过量、暴饮暴食，会加重肠胃的负荷，造成大便的数量增多，排便的频率也会随之提高。另外，要密切关注患者的排便状况，看看有没有出现其它的不舒服的表现。出现腹泻的时候，出现了大量的粪便，可能与肠炎、结肠炎、克罗恩病、细菌性痢疾等疾病相关。而平时排便频繁，但每次大便量不多，甚至出现排便困难等症状，可能与肠易激综合征、肠道肿瘤等疾病有关，建议前往医院就诊。
