通常来说，慢性肠炎肚子疼吃枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊、阿托品、山莨菪素等药。
慢性肠炎肚子疼可能是由于长期的炎症所致的肠神经受到了刺激导致的，可以口服枯草杆菌二联活菌肠溶胶囊等调节肠道菌群的药物，还可以配合阿托品、山莨菪素等解痉镇痛类的药物。平时也要避免食用过多的生冷和辛辣的食品，避免对肠胃造成刺激，导致病情恶化。
治疗小儿慢性肠炎看医生开药，吃药加调整饮食习惯，多吃一些蔬菜水果，避免吃一些零食以及生冷刺激的食物，平常要适当的锻炼身体，有助于改善症状。多给孩子做腹部热敷，腹部保暖。
小儿消化不良导致的，反复发作的餐后饱胀、早饱、厌食、嗳气、恶心、呕吐、上腹痛、上腹烧灼感或反酸为主要表现，而经各项检查排除器质性、系统性或代谢性疾病。饮食定时定量，给予易消化食物。
首先要看孩子的慢性肠炎是哪类型的，如是细菌性肠炎，这时是可用抗生素治疗的，具体用药可由医师指导服用，另外注意治疗儿童慢性肠炎要坚持用药治疗，否则在症状稍好点炎症没消退时停药是会引起复发的，所以一定要听从医嘱。
主要由于饮食因素、感染等引起的急性肠胃炎。建议家属掌握相关育儿知识，注意宝宝的饮食卫生和饮食营养，宝宝呕吐时头偏向一侧，及时清理呕吐物，保持口腔清洁，暂停进食1到2餐。同时带宝宝到正规医院儿科就诊，进行血常规、大便常规检查，根据检查结果使用相应的药物治疗。
