一般情况下，扁平疣去除可以用维A酸软膏、咪喹莫特软膏等，具体内容如下：
扁平疣去除可以用0.05%-0.1%的维A酸软膏来清除扁平疣，一天1-2次，清洗干净后再涂上5%的咪喹莫特软膏。可以口服免疫调节剂，如干扰素、左旋米唑等。其次可以采用物理治疗，如冷冻、电灼等。另外还要多做运动，提高身体素质。人乳头状瘤病毒会导致皮肤粘膜疾病，当人体的免疫力提高后，扁平疣就会自动消失。
如果有扁平疣，可通过以下药物治疗：
1.可以服用重组人干扰素α-2b凝胶、咪喹莫特软膏等调整免疫力的药物；
2.还可以选择维A酸乳膏、他扎罗丁凝胶、阿达帕林凝胶等维甲酸类的药物。外用药渗透性、吸收性都比较差，而且皮损比较多；
3.可以通过激光、电灼等物理疗法来进行；
4.免疫功能低下的人容易得扁平疣，所以可以服用一些可以提高免疫力的药物，例如转移因子胶囊。
人体免疫力下降也容易导致疾病的发生，治疗期间可以加入薏米的，对于扁平疣的治疗我个人首选激光去除疣体，再结合药物治疗更佳。薏米有药食两用的功效，薏米有祛湿，提高免疫力的作用，对于用于扁平疣的治疗也是可以的，扁平疣属于病毒感染所引起的。
采取冷冻的方法治疗，另外可以根据病情使用抗病毒药物治疗，药物只是起到抑制作用，丝状疣是寻常疣的一种特殊类型，是由人乳头瘤病毒感染引起的疾病，具有传染性，多发生在颈部，腋下臀部，治疗比较棘手，容易反反复复。
扁平疣用醋是有可能去掉的，白醋的作用是改疣周围的化学环境，使疣萎缩坏死，但这样的情况下周围正常的组织也会坏死，所以这种方法可行。不要在强光下暴晒，可以多吃富含维生素的食物，比如葡萄，苹果，猕猴桃，香菇等，有利于促进皮肤恢复原来的健康。
液氮冷冻治疗扁平疣费用在500-1000元左右。液氮冷冻治疗是皮肤科非常常用的一种治疗手段，主要用于治疗尖锐湿疣、寻常疣、脂溢性角化、鸡眼等。收费标准在不同城市、不同地区都是有差别的，不能一概而论。