卵巢囊肿的手术治疗方法包括腹腔镜手术与开腹手术两种手术途径。开腹手术包括开腹的卵巢囊肿剥除术以及开腹的患侧附件切除术；腹腔镜手术包括腹腔镜下卵巢囊肿剥除术以及腹腔镜下患侧附件切除术。对于年轻、有生育要求的病人，卵巢囊肿一般选择腹腔镜卵巢囊肿剥除术或者开腹卵巢囊肿剥除术。对于年龄比较大、没有生育要求、或者绝经后的女性，可以选择开腹的患侧附件切除术或者腹腔镜下患侧附件切除手术。
如果有卵巢囊肿，大小如果大于3.0厘米以上都应该进行手术治疗，目前临床上治疗卵巢肿瘤，以手术治疗为主，如果有生育要求，可以保留部分卵巢组织，外用药物效果不，尽早手术治疗，目前治疗卵巢囊肿的手术有腹腔镜，只要在肚子上打几个孔，就可以将手术完成。
卵巢囊肿没有超过4.0以上，可以考虑用保守治疗的方式。如果大于4.0了手术治疗比较好，有卵巢囊肿的女性最常见的症状就是小腹部有硬块，阴道不规则出血，小腹疼痛等。所以确诊后积极的治疗，平时多注意局部卫生，治疗期间不要有性生活。
轻微的卵巢囊肿通常不需要治疗，当囊肿大于5厘米就需要手术治疗。治疗卵巢肿瘤，以手术治疗为主，如果有生育要求，可保留部分卵巢组织，外用药物效果不大，建议尽早手术治疗，目前治疗卵巢囊肿的手术有腹腔镜，只要在肚子上打几个孔，就可以将手术完成。
卵巢囊肿手术治疗后大概一个月能恢复。卵巢囊肿病人在术后如果保养得当恢复的还是比较快的，大多数的病人在术后一个月的时间身体基本恢复，并且一个月后，就可以进行性生活，良好的护理可以让病人的康复时间大大缩短。
卵巢囊肿分为生理性囊肿和病理性囊肿，通常为良性囊肿，几乎没有恶性病变。如果生理性囊肿在黄体囊肿中很常见，通常随着月经而变化，也就是说，可以发现在下次月经干净后逐渐减少甚至消失。病理囊肿不能消失。如果没有症状，不太直接的症状暂时不需要手术。定期的症状检查可以结合药物进行。如果囊肿逐渐增大，如果直径大于5厘米，月经和腹痛症状都会受到影响。有手术特征的，可以选择腹腔镜或开腹手术进行切除。
