可以吃相关药物防止发生感染，但最主要是要坐浴换药，更换药条要准确到位，防止发生假性愈合，忌食辛辣刺激，定期到医院复查。平时注意休息，不要让身体出现什么不适，保持心情愉悦。
肛瘘多为化脓性感染所致，少数为特异性感染，如结核、克罗恩病、溃疡性结肠炎等感染亦可所致。最佳治疗办法可以手术处理。通常术后需要半月到一月时间恢复，手术观察期间一定要注意饮食生活作息，少吃辛辣刺激的食物，少喝酒，多注意局部的卫生清洗，勤换内裤。
做完手术以后一定要注意饮食，不要吃辛辣刺激性的食物，饮食要以清淡为主，多吃水果和蔬菜，多喝水尽量保持大便通畅，可以服用一些消炎类的药物，定期去换药也是很重要的。每天都洗澡。
肛瘘手术要忌辛辣刺激，多食新鲜蔬菜水果，少食多餐。预防大便干燥，每天温水坐浴，注意局部的清洁卫生，消毒伤口预防感染。需要注意营养来改善，同时需要注意休息帮助改善。
肛瘘挂线是一种方法，所谓挂线分两种。一种是浮线，是用线从管道穿出去，不系住，有的时候可以标记，为下次做手术做准备。再一个可以引流，让管道里面的脓液、分泌物引出来，这一般叫浮线，就是不紧线。还有一种是管道灶上用线穿出去，然后用线系紧。
