可以先进行局部治疗，首先是消除一些局部不良刺激因素，如酒精、烟草、牙结石、牙洞或牙齿填充材料等。然后可以用肾上腺皮质激素治疗，如软膏、药膜、喷雾剂等。对于糜烂型溃疡患者，可封闭治疗，在病变部位底部注射激素。
目前尚没有特别有效的方法进行治疗。药物治疗一般以使用免疫抑制剂和糖皮质激素治疗为主，它是一种非感染性慢性炎症性疾病。典型皮损为紫红色多角形扁平丘疹，常有口腔粘膜损害。扁平苔藓是一种癌前病变，可能转化为癌。
口腔扁平苔癣的治疗方法，包括局部治疗、全身治疗。局部治疗是去除局部刺激因素，进行局部的封闭，对于比较轻的扁平苔癣有一定的效果。口腔扁平苔癣的治疗，并不能够明确的使口腔扁平苔癣完全恢复，都是一些对症性的治疗。
外阴慢性单纯性苔藓的治疗方法一般有药物治疗、物理治疗。外阴局部摩擦可能会导致长期慢性刺激，引起外阴慢性单纯性苔藓，此时一般可以进行药物治疗，患者可以在医生的指导下使用如复方醋酸地塞米松乳膏、丁酸氢化可的松软膏、马来酸氯苯那敏片等药物进行治疗。同时也可能进行物理治疗，一般可以通过二氧化碳激光治疗、液氮冷冻等方式进行治疗，以缓解症状。同时治疗期间需要保持局部清洁。
如果口腔粘膜的粘膜只是变色，没有破溃的可以使用鱼肝油就局部涂抹，每天至少2次，如果局部粘膜有充血发红，破溃则可以用鱼肝油加上地米局部涂抹也可以直接使用口腔软膏涂抹。
