新生儿促甲状腺激素偏高的治疗方法，主要是根据甲状腺激素的水平进行选择。
1.若新生儿的促甲状腺素仅有轻微升高，则只要进行常规的检查，不需特别治疗，大部分情况下都能在一定程度上痊愈。
2.若新生儿的促甲状腺激素偏高，持续做了多项检测，出现了高的甲状腺激素，并且出现了持续不退、拒乳、嗜睡等症状时，可以口服左甲状腺素钠片、碘塞罗宁钠等。通过药物的处理，儿童的病情可以得到很好的改善。
新生儿筛查甲状腺偏高，首先家长要积极送患儿去医院定期接受微量元素检测，仔细观察病情。
如果婴儿甲状腺激素高症状轻的人，为了避免病情恶化，可以在饮食上调整不摄入高热量、高蛋白、高碘的食物。症状严重时，患者可服用甲状腺激素抑制剂帮助治疗，必要时婴儿长大后可前往医院外科手术切除甲状腺帮助治疗。有些孩子在生后6个月逐渐会恢复到正常。
每一个活产新生儿，生后3天，均需要采足底血进行新生儿疾病筛查。新生儿疾病筛查四种疾病，其中有一项是筛查先天性甲状腺功能低下，指标为TSH。新生儿TSH正常范围小于6个单位，6-10单位之间可以观察，大于10个单位（尤其是大于15个单位），需尽早干预并完善甲状腺B超及抗甲状腺球蛋白抗体等。
新生儿促甲状腺激素水平在新生儿筛查项目中用于筛查先天性甲状腺功能低下。
如果宝宝的促甲状腺激素升高，怀疑先天性甲状腺功能下降，需要重新检查促甲状腺激素和甲状腺激素的水平。如果仍然偏高，甲状腺激素低于正常，则表现为甲状腺功能下降，需要立即开始甲状腺激素替代治疗，定期复查调整药物剂量。可能是先天性甲状腺功能下降，也可能是甲状腺功能暂时下降。甲状腺激素水平正常，促甲状腺激素稍高，无甲状腺功能减退症状，不治疗，定期复查，甲状腺功能成熟后促甲状腺激素可正常降低。这在早产新生儿中很常见。
G6PD缺乏症俗称蚕豆病，新生儿筛查弱阳性需要去进一步确诊的。蚕豆病吃了蚕豆会发生溶血反应，表现为皮肤黄疸，紫癜等。蚕豆病患者不能用磺胺类退烧药，发烧感冒需要在医生指导下用药。如果G6PD弱阳性，确诊一下是否蚕豆病，因为新生儿初筛只是取一滴血，所以难免会出现误差。
新生儿促甲状腺激素正常范围一般为1-6mu/L，过高可能甲状腺功能亢进，过低可能甲状腺功能减退。
新生儿促甲状腺激素一般在出生后第3天进行检测，促甲状腺激素是测定甲状腺功能的重要指标，正常范围一般为1-6mu/L。新生儿促甲状腺激素大于6mu/L应复查，复查结果仍大于6mu/L应检查婴儿甲状腺功能。如果检测结果是阳性，一般可诊断婴儿为甲状腺功能亢进症，家长建议在医生指导下，对婴儿使用甲硫嘧啶、丙硫嘧啶等药物治疗。如果甲状腺激素低于1mu/L，伴有宝宝活动少、食欲差等症状，提示宝宝可能患有甲状腺功能低下，建议家长在医生指导下应用左甲状腺激素治疗。
