进行肛门检查，首先应当选择合适的体位，可选择膝胸位、截石位、弯腰俯卧位，有时也可以采取左侧卧位，选择合适的体位，对检查疾病有很大的帮助。首先应当进行肛门视诊，观察肛门的位置是否有异位变形等。然后观察肛门周围的皮肤及颜色，是否存在着红斑、糜烂、渗出，是否有肿物。
男科或者是泌尿外科都会做一些性功能的测试。
影响性功能的因素有血管性和神经方面的生理和生理方面。首先是夜间阴茎勃起试验来判断精神上的问题，并在此基础上确定其器质性的原因。
如果发现了器官病变，可以通过以下几种方法来确诊，如阴茎勃起功能检查、阴茎海绵体血流超声检查、输精管造影、阴茎海绵体造影等。
性功能检查是男科的。
男性性功能检查应该在男科专科由专业的男科医生帮助下完成。不同的男性性功能障碍或疾病所需要完成的检查项目各有不同，常见的包括雄激素、催乳素和其他激素等检查，有利于明确是否存在勃起功能障碍、早泄、射精迟缓、不射精症男性性腺功能减退症等问题。
一般性功能检查男科、泌尿外科、生殖健康医学科等科室可以做。
男科、泌尿外科、生殖健康医学科等科室对性功能进行检查，排除了器质性疾病，可以通过简单的药物和外科的方法来进行恢复。如前列腺炎、阴茎海绵体动脉硬化、阴茎海绵体供血不足、阴茎海绵体动脉静脉瘘等，都要做手术。
性功能检查可以挂男科或者泌尿外科。
性功能检测包括男性勃起功能检测，也可进行视听性刺激勃起检测、视听性刺检测等。男性在进行性功能检测的同时也可进行阴茎海绵体造影，通过阴茎海绵体造影能够对是否存在阴茎海绵体动静脉瘘，以及是否存在阴茎动脉供血狭窄进行客观的评估。
